太子参玉米黄质环氧化酶基因的克隆与表达分析(3)
2 结果与分析2.1 太子参PhZEP基因的克隆 通过太子参转录组数据库得到1条ZEP基因的转录本序列,长1 833 bp,包含1个1 263 bp的ORF,编码420个氨基酸,1~104 bp为5′非编码序列(5′UTR),1 368~1 833 bp为3′UTR。利用其全长CDS序列的特异引物PhZEP-F与PhZEP-R,以太子参块根木质部cDNA为模板,经RT-PCR扩增、克隆和测序分析得到1条大小为1 263 bp的片段,与预测结果一致,见图1。
2.2 太子参PhZEP基因的序列分析 通过Protparam预测结果显示PhZEP蛋白的分子式为C2107H3305N581O624S18,相对分子质量为47.34 kDa,等电点pI 6.64。不稳定系数为44.87,脂肪系数为84.95,平均亲水性系数为0.329,说明PhZEP基因编码蛋白是亲水性蛋白。同源性比对分析发现,该基因与甜菜(Beta vulgaris subsp. vulgaris,XP_010670730.1)的ZEP序列相似性最高,达73%。PhZEP基因的结构域属于NADB_Rossmann超家族成员 ......
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