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编号:13006764
基于计算机辅助水解的中药大豆寡肽的ETA拮抗活性预测(2)
http://www.100md.com 2017年2月15日 《中国中药杂志》 2017年第4期
     中药大豆是豆科植物大豆Glycine max的成熟种子,现代研究表明大豆活性肽具有良好的降压活性[5]。内皮素受体A(endothelin receptor A,ETA)是治疗高血压和肺动脉高压的经典靶标,其第一代拮抗剂即为肽类化合物[6]。因此,基于大豆寡肽开发ETA拮抗剂具有较高的研究价值。本研究拟利用计算机辅助水解技术,进行中药大豆的模拟消化水解,并结合基于药效团和分子对接的虚拟筛选技术,预测中药大豆寡肽的ETA拮抗活性。

    1 材料与方法

    1.1 大豆蛋白的模拟水解 本研究在Uniport(http://www.uniprot.org/)中检索已解析的大豆种子储存蛋白的多肽序列,共获得5条大豆球蛋白(glycinin)和3条伴大豆球蛋白(conglycinin)序列,主要包括大豆球蛋白G,大豆球蛋白G1-G4,β-伴大豆球蛋白的α,α′和β链。其为大豆中的主要储存蛋白,占分离蛋白的80%以上[7]。基于获得的蛋白序列,本研究采用BIOPEP(http://www.uwm.edu.pl/biochemia/index.php/pl/biopep)进行计算机辅助模拟水解 ......
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