基于计算机辅助水解的中药大豆寡肽的ETA拮抗活性预测(3)
2 结果与讨论2.1 大豆寡肽库的构建 通过模拟水解,本研究共获得449条多肽,其中各段寡肽的数目分布见图1,由于2~6肽可能具有较好的相对分子质量与成药性[2],所以选择2~6肽共299条作为本研究的主要研究对象。通过对模拟水解结果与已知的活性肽数据库BIOPEP比对,共发现已知活性肽32条,其主要的生物学活性包括ACE抑制作用和抗氧化作用等,其结果见表1,表明大豆寡肽具有较为广泛的药理活性。
2.2 ETA肽类拮抗剂药效团模型的建立与评价 基于Hypogen的药效团建模方法主要包括2类内部评价参数,即训练集活性化合物的预测结果与真实活性的相关系数Corrtrain,以及费用函数(Cost)对所构建的药效团模型的显著性评价。本研究构建的10个药效团内部评价参数见表2。模型的Null Cost为425.75,ΔCost为Null Cost与Total Cost的差值,ΔCost大于60说明模型有90%以上的显著性。
利用测试集对10个候选药效团进行评价,计算相应外部评价参数,包括药效团的活性化合物命中率HRA、辨识有效性指数IEI和综合评价指数CAI以及测试集中活性化合物的预测值与真实值之间的相关系数Corrtest ......
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