藏药臭蒿及其近缘种药材的ITS2 DNA条形码鉴别(3)
3.3 NJ树分析 根据ITS2序列对所有样本构建NJ系统聚类树,见图2,利用bootstrap 1 000次检验各分支的置信度。从NJ进化树图可以看出,臭蒿、牛尾蒿、黄花蒿、艾蒿各样本种内之间各单独形成一个分支。牛尾蒿与艾蒿与臭蒿亲缘关系较远,臭蒿和黄花蒿的亲缘关系较近,在NJ树上聚为一大支,但分支之间bootstrap置信度在70%以上,物种之间可明显区分开。3.4 ITS2二级结构的分析 根据Koetschan等建立的ITS2数据库及其网站预测的臭蒿、牛尾蒿、艾蒿、黄花蒿ITS2二级结构见图3,从样本的二级结构中可以看出臭蒿、牛尾蒿、艾蒿、黄花蒿的ITS2序列二级结构较为相似,均为一个中心环(主环)及4个螺旋区(helix)组成,每个螺旋上又有大小不同数目各异的茎环(loop)结构。艾蒿在螺旋Ⅲ区上茎环(loop)数量不同,在中部位置多出1个茎环,Ⅰ区颈环结构也有不同。牛尾蒿ITS2序列二级结构在Ⅲ区的茎环结构较其他三者明显不同。臭蒿与黄花蒿ITS2序列二级结构极为相似,从结构上无法将臭蒿与黄花蒿区分开 ......
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