淹水胁迫对杭菊花色苷及合成相关酶和基因的影响(2)
2.1 RNA提取与cDNA合成 利用Trizol法提取总RNA。提取后用琼脂糖胶电泳检测RNA的质量,并使用核酸检测仪检测所提RNA的浓度和纯度。取10 μL RNA作为模板,按照反转录试剂盒说明书进行反轉录得到cDNA第一链。
2.2 引物特异性检测 根据杭菊CHS,DFR基因设计荧光定量PCR引物CHSq-F:5′-TCGTTGGTCAAGCTTTGTTC-3′和CHSq-R:5′-CTCCCTCCGAGTCTGGTAAG-3′;DFRq-F:5′-GACATTATGGAAGGCGGATT-3′和DFRq-R:5′-GTGGCAACATGAAACACTC-3′;内参基因引物为actin-F:5′-ACAACTGCTGAACGGGAAAT-3′和actin-R:5′-TCATAGACGGCTGGAAAAGG-3′。反应体系如下:cDNA 2 μL;10×Taq buffer 2 μL;ExTaq 0.2 μL;Mg2+ (25 mmol·L-1) 2 μL;dNTP(2.5 mmol·L-1)2 μL;引物 ......
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2.2 引物特异性检测 根据杭菊CHS,DFR基因设计荧光定量PCR引物CHSq-F:5′-TCGTTGGTCAAGCTTTGTTC-3′和CHSq-R:5′-CTCCCTCCGAGTCTGGTAAG-3′;DFRq-F:5′-GACATTATGGAAGGCGGATT-3′和DFRq-R:5′-GTGGCAACATGAAACACTC-3′;内参基因引物为actin-F:5′-ACAACTGCTGAACGGGAAAT-3′和actin-R:5′-TCATAGACGGCTGGAAAAGG-3′。反应体系如下:cDNA 2 μL;10×Taq buffer 2 μL;ExTaq 0.2 μL;Mg2+ (25 mmol·L-1) 2 μL;dNTP(2.5 mmol·L-1)2 μL;引物 ......
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