药用植物分子育种展望(2)

http://www.100md.com 2017年6月1日 《中国中药杂志》2017年第11期

     遗传连锁作图包括遗传标记分离、连锁关系、排序分析和遗传距离估算等步骤，开发有MAPMAKER/EXP[11]，Joinmap[12]，CarthaGene[13]等多种作图软件。这些软件在数据准备难易、可视化程度和功能等方面存在较大不同。其中，广泛使用的有MAPMAKER/EXP 3.0，Joinmap 4.0等软件。MAPMAKER/EXP 3.0适用于BC1，F2，RIL等群体遗传连锁图谱构建及复合性状基因定位。Joinmap 4.0适用于BC1，F2，RIL，DH等群体遗传连锁图谱构建及整合。

    遗传连锁图谱还难于直接在育种中发挥作用，主要用于QTL定位、基因克隆、性状遗传分析和基因组比较研究，其饱和度直接影响到QTL定位精确性。因此，构建高密度遗传连锁图谱对QTL定位十分必要。遗传连锁图谱上标记平均间隔，连锁框架图谱要求不大于20 cM；主效基因定位要求在10～20 cM或更小；QTL定位要求在10 cM以下；基因克隆要求目标区域在1 cM以下[14]。现有遗传连锁图谱多数是由不同群体、标记、研究者、实验条件下所构建的，饱和度不够高。多标记多群体作图增加标记位点和图谱整合是增加遗传连锁图谱饱和度的有效途径。在具备共有标记可用条件下，可直接采用“锚定标记策略”，将不同遗传连锁图谱整合成一张公共图谱、一致性图谱。这不仅可以增加图谱的饱和度，还可以扩展图谱的应用范围。在无共有标记可用条件下 ......