濒危兰科药用植物DNA条形码鉴定(3)
3.3 NJ树分析
采用Bootstrap 1 000次重复，仅显示自展支持率≥50%的数值。
将135种兰科药用植物的163条matK、163条psbA-trnH和161条ITS2序列分别运用NJ法构建系统进化树(图2)。matK，psbA-trnH，ITS2这3种序列的兰科药用植物NJ树中，各属物种均分别聚成一支，各物种的多条序列也分别聚成一支，3种序列相互补充，能够很好地将此研究中所做的兰科药用植物各物种区分开。其中matK序列构建的NJ树中各亚族能够很清晰地被分开，白及亚族与笋兰亚族及贝母兰亚族聚成一支，树兰族的香荚兰亚族没有和其他树兰族的物种聚成一支，柄唇兰亚族与毛兰亚族聚成一支，鸟巢兰族各亚族聚成一支，杓兰亚科各物种聚成一支。psbA-trnH序列构建的NJ树中各亚族能够很清晰地被分开，但杓兰亚科的物种没有聚成一支，毛兰亚族各属聚成了2支，鸟巢兰族各亚族聚成一支。ITS2序列构建的NJ树中各亚族能够很清晰地被分开，白及亚族与笋兰亚族及贝母兰亚族聚成一支 ......
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采用Bootstrap 1 000次重复，仅显示自展支持率≥50%的数值。
将135种兰科药用植物的163条matK、163条psbA-trnH和161条ITS2序列分别运用NJ法构建系统进化树(图2)。matK，psbA-trnH，ITS2这3种序列的兰科药用植物NJ树中，各属物种均分别聚成一支，各物种的多条序列也分别聚成一支，3种序列相互补充，能够很好地将此研究中所做的兰科药用植物各物种区分开。其中matK序列构建的NJ树中各亚族能够很清晰地被分开，白及亚族与笋兰亚族及贝母兰亚族聚成一支，树兰族的香荚兰亚族没有和其他树兰族的物种聚成一支，柄唇兰亚族与毛兰亚族聚成一支，鸟巢兰族各亚族聚成一支，杓兰亚科各物种聚成一支。psbA-trnH序列构建的NJ树中各亚族能够很清晰地被分开，但杓兰亚科的物种没有聚成一支，毛兰亚族各属聚成了2支，鸟巢兰族各亚族聚成一支。ITS2序列构建的NJ树中各亚族能够很清晰地被分开，白及亚族与笋兰亚族及贝母兰亚族聚成一支 ......
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