濒危兰科药用植物DNA条形码鉴定(1)

http://www.100md.com 2017年6月1日 《中国中药杂志》2017年第11期

     [摘要] 兰科药用植物形态分类困难，此研究采用DNA条形码分子鉴定法从分子水平验证兰科药用植物的传统形态分类。以matK，psbA-trnH和ITS2序列作为DNA条形码对已进行了形态鉴定的49属135种163份兰科药用植物样品进行分子鉴定，经DNA提取，PCR扩增、双向测序及校对拼接后，将得到的序列在GenBank中进行BLAST比对，然后运用MEGA 7.0软件中的Neighbor-joining (NJ)法构建物种系统进化树。结果表明，163份样品均能成功提取DNA；matK，psbA-trnH和ITS2序列的PCR扩增效率分别为100%，100%，98.77%；共获得487条序列，其中345条序列在GenBank数据库中比对到了相应物种的序列，142条为新增序列；运用NJ法构建的兰科药用植物系统进化树中，基于matK序列所构建的物种系统进化树要优于基于psbA-trnH和ITS2序列所构建的系统进化树。matK，psbA-trnH和ITS2序列在鉴定兰科药用植物过程中互为补充 ......