黄芪六一汤对2型糖尿病治疗效果的转录组学研究(1)
[摘要]该实验采用Illumina测序平台对大鼠胰腺进行转录组测序，对靶点进行表达量统计，分析空白组、模型组、黄芪六一汤组三者之间的表达差异关系，探究黄芪六一汤对2型糖尿病的治疗效果，并探讨其作用机制。结果表明，通过eggNOG对基因进行分类分析，其中有2425%的基因属未知功能类，为最大分类单元，其余依次为能量转换类、氨基酸转运和代谢类、核苷酸转运和代谢类、碳水化合物转运和代谢类、辅酶转运和代谢类、脂质转运和代谢类等；根据KEGG富集分析，黄芪六一汤可能在环境信息处理、细胞过程、生物系统、人类疾病这4类代谢通路上对2型糖尿病起到治疗作用。研究表明，黄芪六一汤能显著改善2型糖尿病大鼠空腹血糖、糖化血红蛋白。
[关键词]黄芪六一汤； 2型糖尿病； 转录组学； eggNOG分析； KEGG富集分析
[Abstract]In this study， Illumina sequencing platform was applied in sequencing rat pancreas， counting expression of target points， analyzing expression differences among blank group， model group and Huangqi Liuyi decoction group and exploring the therapeutic effect and mechanism of Huangqi Liuyi decoction on type 2 diabetes mellitus According to the result， 2425% of these genes belonged to the unknown functional class， which was the largest classification unit according to the classification analysis of genes by eggNOG The rest were classified as energy conversion， amino acid transport and metabolism， nucleotide transport and metabolism， carbohydrate transport and metabolism， coenzyme transport and metabolism， and lipid transport and metabolism， etcHuangqi Liuyi decoction may play a therapeutic role in the treatment of type 2 diabetes mellitus through four metabolic pathways， namely environmental information processing， cellular process， organismal system and human diseases according to KEGG enrichment analysis This study shows that， Huangqi Liuyi decoction can significantly improve the fasting blood glucose and glycosylated hemoglobin in type 2 diabetic rats
, 百拇医药
[Key words]Huangqi Liuyi decoction； type 2 diabetes mellitus； transcriptomics； eggNOG analysis； KEGG enrichment analysis
糖尿病是一種以失控的高血糖为主要表现，多种并发症为主要损害的一种代谢性疾病，病程长且复杂，难以根治，已严重影响人们的健康生活[1]。中药及中药复方对糖尿病起到了治疗作用，常用中药有人参、黄芪、地黄、甘草等[2]。其中，黄芪多糖可抑制由内质网压力引起的活化转录因子的活性，增加2型糖尿病大鼠肝脏组织中的AMPK磷酸化水平，降低蛋白酪氨酸磷酸酶1B(PTP1B) 的过表达，以提高大鼠胰岛素敏感性，增加KKAy大鼠对高血糖症和口服葡萄糖的耐受性[36]。Honda K等[7]将减少血浆胰岛素浓度作为改善胰岛素抵抗的指标，并通过实验证明甘草总黄酮明显降低血浆胰岛素浓度，因此推测甘草总黄酮能改善胰岛素抵抗。黄芪六一汤由黄芪、炙甘草组成，具有补气、生津等功效。转录组(transcriptome)是指特定细胞在某一功能状态下全部表达的基因总和，代表了每一个基因的身份和表达水平，转录组测序能全面的地揭示生物个体在特定组织和特定时期的全局基因的表达情况[8]。本实验通过黄芪六一汤对2型糖尿病治疗效果转录组学的研究，表明黄芪六一汤可能通过改善新陈代谢通路从而对2型糖尿病起到治疗作用。
, 百拇医药
1材料
11动物选用SPF级雄性大鼠40只，体质量(200±20) g，鼠龄6～8周(黑龙江中医药大学药物安全评价中心)，许可证号SCXK(黑)2013004。动物饲养于SPF级动物实验室，实验室温度(22～24 ℃)，湿度(45%～55%)，日光照12 h，动物分笼饲养(10只/笼)，自由觅食饮水。实验过程中对动物处置符合动物实验伦理标准。
122型糖尿病大鼠模型构建目前得到2型糖尿病大鼠的方法有2种，第1种是直接购买基因敲除的大鼠，第2种就是国内广大研究人员普遍采用的造模方法[9]，即采用链脲佐菌素(STZ)腹腔注射获得2型糖尿病大鼠。综合实验技术熟练程度、资金等方面因素，采用STZ腹腔注射的方法复制2型糖尿病大鼠模型。, http://www.100md.com(常越 徐姣 闫嵩 刘振鹏 任伟超 张开雪 马伟 刘秀波)
[关键词]黄芪六一汤； 2型糖尿病； 转录组学； eggNOG分析； KEGG富集分析
[Abstract]In this study， Illumina sequencing platform was applied in sequencing rat pancreas， counting expression of target points， analyzing expression differences among blank group， model group and Huangqi Liuyi decoction group and exploring the therapeutic effect and mechanism of Huangqi Liuyi decoction on type 2 diabetes mellitus According to the result， 2425% of these genes belonged to the unknown functional class， which was the largest classification unit according to the classification analysis of genes by eggNOG The rest were classified as energy conversion， amino acid transport and metabolism， nucleotide transport and metabolism， carbohydrate transport and metabolism， coenzyme transport and metabolism， and lipid transport and metabolism， etcHuangqi Liuyi decoction may play a therapeutic role in the treatment of type 2 diabetes mellitus through four metabolic pathways， namely environmental information processing， cellular process， organismal system and human diseases according to KEGG enrichment analysis This study shows that， Huangqi Liuyi decoction can significantly improve the fasting blood glucose and glycosylated hemoglobin in type 2 diabetic rats
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[Key words]Huangqi Liuyi decoction； type 2 diabetes mellitus； transcriptomics； eggNOG analysis； KEGG enrichment analysis
糖尿病是一種以失控的高血糖为主要表现，多种并发症为主要损害的一种代谢性疾病，病程长且复杂，难以根治，已严重影响人们的健康生活[1]。中药及中药复方对糖尿病起到了治疗作用，常用中药有人参、黄芪、地黄、甘草等[2]。其中，黄芪多糖可抑制由内质网压力引起的活化转录因子的活性，增加2型糖尿病大鼠肝脏组织中的AMPK磷酸化水平，降低蛋白酪氨酸磷酸酶1B(PTP1B) 的过表达，以提高大鼠胰岛素敏感性，增加KKAy大鼠对高血糖症和口服葡萄糖的耐受性[36]。Honda K等[7]将减少血浆胰岛素浓度作为改善胰岛素抵抗的指标，并通过实验证明甘草总黄酮明显降低血浆胰岛素浓度，因此推测甘草总黄酮能改善胰岛素抵抗。黄芪六一汤由黄芪、炙甘草组成，具有补气、生津等功效。转录组(transcriptome)是指特定细胞在某一功能状态下全部表达的基因总和，代表了每一个基因的身份和表达水平，转录组测序能全面的地揭示生物个体在特定组织和特定时期的全局基因的表达情况[8]。本实验通过黄芪六一汤对2型糖尿病治疗效果转录组学的研究，表明黄芪六一汤可能通过改善新陈代谢通路从而对2型糖尿病起到治疗作用。
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1材料
11动物选用SPF级雄性大鼠40只，体质量(200±20) g，鼠龄6～8周(黑龙江中医药大学药物安全评价中心)，许可证号SCXK(黑)2013004。动物饲养于SPF级动物实验室，实验室温度(22～24 ℃)，湿度(45%～55%)，日光照12 h，动物分笼饲养(10只/笼)，自由觅食饮水。实验过程中对动物处置符合动物实验伦理标准。
122型糖尿病大鼠模型构建目前得到2型糖尿病大鼠的方法有2种，第1种是直接购买基因敲除的大鼠，第2种就是国内广大研究人员普遍采用的造模方法[9]，即采用链脲佐菌素(STZ)腹腔注射获得2型糖尿病大鼠。综合实验技术熟练程度、资金等方面因素，采用STZ腹腔注射的方法复制2型糖尿病大鼠模型。, http://www.100md.com(常越 徐姣 闫嵩 刘振鹏 任伟超 张开雪 马伟 刘秀波)