基于高通量测序的药用植物“凤丹”根皮的转录组分析(1)
基于高通量测序的药用植物“凤丹”根皮的转录组分析,牡丹皮,次生代谢,差异基因,简单重复序列
[摘要]牡丹皮為我国传统常用中药，安徽省铜陵地区栽培的“凤丹”根皮加工而成的药材牡丹皮被誉为道地药材，药用活性成分丰富多样，但目前尚不清楚 “凤丹”药用部位次生代谢过程中活性物质合成的遗传学基础。研究采用Illumina HiSeq 4000高通量测序平台对五年生“凤丹”根皮转录组进行测序，对测序结果进行de novo 拼接和功能注释，测序后获得72 997条unigene。进一步利用公共数据库进行同源比对，其中41 139条unigene被Nr数据库成功注释，34 952条unigene能被GO数据库成功注释，20 016条unigene被KEGG数据库成功舒注释，共涉及到5个大类、34个种类、352条代谢通路；在次生物质合成与代谢途径中，其中苯丙素类化合物、萜类化合物骨架合成、各种类型萜类化合物、生物碱类化合物以及黄酮类成分生物合成途径中的unigene分别有214 ......
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