基于16S rDNA测序技术分析不同龄期蚕沙中菌群多样性(4)
25Beta多样性分析基于UniFrac[22]距离上对属水平各样品之间进行加权(weighted)和非加权(unweighted)的主坐标分析(principal coordinate analysis，PCoA)，同时采用基于UniFrac的非加權组平均法(unweighted pairgroup method with arithmetic means，UPGMA)进行样品聚类。6种样品微生物群落构成的PcoA图中，坐标轴括号中的百分比代表了对应的主成分所能解释的原始数据中差异的比例(图6)，基于UniFrac的加权和非加权的主坐标分析(weighted and unweighted UniFrac principal coordinate analysis)其第一主成分和第二主成分的贡献率分别为4423%，1811%和5535%，3204%。说明在加权和非加权主坐标分析中所选主成分均可以充分解释原始数据中的差异。通过图中样品点距离的远近，可观察个体或群体间的差异，样品点越相近说明样品间微生物群落构成越相似。由基于UniFrac的非加权主坐标分析图(图6A)和基于UniFrac的加权主坐标分析图(图6B)可知 ......
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