三七病程相关蛋白PR102基因的克隆、表达及功能初步分析(3)
将PnPR102序列输入NCBI中的ORF(open reading frame finder)(wwwncbinlmnihgov/gorf/gorfhtml) 和DNAMAN软件分析序列，结果显示PnPR102全长465 bp，编码154个氨基酸(图1)。同时，用ExPASY(ProtParam)软件分析PnPR102编码的蛋白质相对分子质量为16 5828，理论pI 441，分子式 C743H1180N182O239S3。PnPR102的154个氨基酸中碱性氨基酸(R，H，K)13个，酸性氨基酸(D，E)22个，非极性氨基酸(A，V，L，I，F，W，M，P)有66个，非电离的极性氨基酸(G，S，T，C，Y，N，Q)有53个。其中，带负电荷的氨基酸包括D和E，共计22个，带正电荷的氨基酸包括R和K，共11个。22PnPR102基因的生物信息学分析三七PnPR102序列经Blastn比对后，检测与之覆盖率相对较高的几种植物，并获得与三七PnPR102蛋白相似其他植物PR蛋白质序列。选择与三七PnPR102蛋白亲缘关系相对较近的人参、胡萝卜、香芹菜、山芹菜、马铃薯、丹参、猕猴桃等植物的PR蛋白进行氨基酸序列比对 ......
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