MicroRNA(miRNA)参与转录后基因表达调控。miR-155已被证明可调节疟原虫等顶复门寄生虫宿主免疫反应。有报道称大脑内皮细胞miR-155在实验性自身免疫性脑脊髓炎、LPS致系统性炎症过程中血脑屏障完整性和T细胞功能调节方面发挥负性调控作用。与野生型小鼠相比，miR-155基因敲除可显著提高实验性脑型疟小鼠生存率和血脑屏障完整性、减少内皮细胞激活，降低微血管通透性，且此作用与Ang/Tie2 系统有关。提示抑制miR-155的功能可改善脑型疟症状，miR-155或可成为一个脑型疟治疗干预的潜在的辅助治疗靶标[49]。

    细胞因子信号抑制因子2(suppressor of cytokine signaling 2，SOCS2))是由细胞因子和激素诱导的细胞内蛋白，可调节免疫应答、神经营养与发育、神经发生等。与野生型小鼠相比，实验性脑型疟模型PbA感染早期SOCS2基因敲除可显著降低寄生虫血症，减少脑组织中TNF-α，TGF-β，IL-12和IL-17，但在感染后期SOCS2基因敲除小鼠则有加重寄生虫血症倾向，同时Treg细胞浸润减少，脑中相关细胞因子水平升高，而保护性神经营养因子如神经胶质细胞系衍生神经营养因子(glial cell line-derived neurotrophic factor ......