高皂苷人参株系早期筛选的研究(2)
2.4 特异性引物PCR反应体系的优化 以回收2.3特异性条带为优化模板DNA,对模板DNA、引物、dNTP、Mg2+和Taq酶5个因素的适宜浓度进行优化[4-6],具体见表2,PCR反应程序同上。采用L16(45)正交试验确定该PCR反应体系5个因素的最优组合,每个因素依据单因素试验结果设定4个水平。正交试验水平信息见表3。
2.5 特异性引物PCR反应验证 根据优化的PCR体系对另24株供试人参基因进行扩增,电泳检测结果。测定和分析各株人参皂苷,方法同2.3,验证引物的准确性。
2.6 特异性片段测序与分析 使用凝胶回收试剂盒回收特异性条带,并送往TKARA公司进行测序。测序结果与NCBI数据库进行同源性比对。
3 结果与分析
3.1 DNA提取 供试人参DNA经1%琼脂糖凝胶电泳检测,条带清晰,见图1。经酶标仪检测,DNA样品A260/A280均在1.8~2.0,说明所提DNA完整性好,纯度较高,可作为PCR的模板。
3.2 特异性引物筛选 引物扩增结果见图2,仅GC1引物的13,14号样品分别在约2 000,1 200 bp处各有1条特异性条带,14号人参样品9种皂苷加和值最高,见图3和表4。
3.3 特异性引物PCR反应体系优化 GC1引物的最优PCR体系为:DNA质量浓度2.60 mg·L-1 ......
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