Ataxin-3与相关疾病的分子机制的研究进展(1)
【摘要】 Ataxin-3 (AT3,ATXN3)是一种重要的去泛素化酶,正常情况下,它参与基因转录、蛋白代谢、磷酸化以及自身泛素化水平的调节。然而突变的Ataxin-3的表达可致转录失调,导致细胞毒性和神经退行性变疾病,如脊髓小脑共济失调3(SCA3)。AT3的异常不仅能导致神经性病变,而且据最近世界各地的研究表明,AT3的失调可能涉及一些人类癌症或者癌症前期病变(如胃癌、乳腺癌、肺癌、睾丸癌、肝硬化等)的发病机制。虽然目前国内关于ATXN3的研究较少,但在国外已经有大量研究报道,该综述主要总结它的功能与疾病的关系。
【关键词】 Ataxin-3;泛素蛋白酶体系统;聚谷氨酰胺;3型脊髓小脑共济失调
中图分类号:R392.12 文献标志码:A DOI:10.3969/j.issn.1003-1383.2019.09.001
Ataxin-3(AT3,ATXN3)作为一种重要的去泛素化酶在国外已经广泛研究,在国内受到的关注也越来越多,本文就AT3的机制和与它相关的疾病进行综述,着重介绍它的基因表达水平和蛋白结构功能,以此更深入了解它与其他疾病潜在的机制。
1 Ataxin-3基因与表达
ATXN3基因位于染色体14q32.12上,包含了13个外显子,并能选择性剪接不同的蛋白亚型,在血液中已经鉴定出56种ATXN3的剪接体,其中20种可能被翻译成功能性Ataxin-3蛋白[1]。最近研究指出三种结构不同的剪接体[2],分别为Ataxin-3a和Ataxin-3c,还有一个是由Ataxin-3a的C端的外显子10终止单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNP)造成的,导致过早终止密码子突变,因此产生了两个亚型:Ataxin-3aL(长)和Ataxin-3aS(短),这3种不同的剪接体的差异主要表现在羧基末端序列上的不同。
2 Ataxin-3蛋白结构与功能
人类Ataxin-3蛋白是在全身细胞中广泛表达,据报道[2]最长的剪接体AT3有376个氨基酸,分子量约为42 kDa。在结构上,AT3由一个球状的去泛素化N端Josephin结构域(JD)、一个的灵活的C端尾部、C端的两个相互作用的泛素基序(Ubiquitin-interacting motifs,UIMs,也叫LALAL motifs和PUBs)和多谷氨酰胺(Polyglutamine,polyQ)区域构成。其中N端JD位于第1~170位氨基酸上,UIMs在第223~240和243~260位氨基酸上,多谷氨酰胺region在第296~317位氨基酸上。还有一种较短的AT3剪接变体含有373个氨基酸,不同的是在C端含有第三个UIM,这个UIM在第334~351位氨基酸上。此外,在polyQ伸展端(第283~285位氨基酸)的上游发现了一个高度保守的核酸的定位信号(nuclear localization signal,NLS),包含有17个残基,位于第296~312位氨基酸。在这个NLS结构前有一个潜在的酪蛋白激酶Ⅱ(CK-Ⅱ)磷酸化位点(TSEE),位于第277~280位氨基酸,该位点可能与AT3进入细胞核的速度相关。而在JD之后有一个核酸输出信号(a nuclear export signal,NES)位于第174~183位氨基酸上。除此之外,Ataxin-3还包含一些保守序列。这些区域有些已经被研究出具有重要的功能,有些区域可能具有潜在的功能还未被研究出。
不同的Ataxin-3亚型在生理水平上存在差异[2],首先,这三种不同亚型的半衰期存在着差异,Ataxin-3aS的半衰期(12 h)比Ataxin-3c(24 h)和Ataxin-3aL(26 h)要短,降解更快。其次,这三种不同的亚型途径降解存在着差异,Ataxin-3c和Ataxin-3aL是通过自噬(Bafilomycin A1)降解的,而Ataxin-3aS则是通过自噬和蛋白酶体途径降解的,这一点也可以解释Ataxin-3aS半衰期的差异。最后,各亚型的结构和定位不尽相同,Ataxin-3aL和-3aS的C端为疏水性,而Ataxin-3c的C端为亲水性,含有第三个UIM。
从功能上来讲,AT3是一种自发表达的去泛素化酶,在蛋白酶体蛋白降解途径和转录调控中具有重要作用,直接调控泛素-蛋白酶体机制[3]。泛素-蛋白酶体系统(ubiquitin proteasome system,UPS)在真核细胞过程中起着关键的调节作用,包括细胞周期进展、应激反应、信号转导、转录激活和DNA修复。泛素化蛋白水解途径的作用机制是将蛋白导向蛋白酶体降解,清除多余蛋白,維持细胞蛋白正常水平。泛素活化酶(E1)、泛素偶联酶(E2)、泛素连接酶(E3)三种蛋白串联,共价将蛋白泛素连接到底物上,构建蛋白酶体识别所需的多聚泛素链。Parkin是一种环间E3连接酶,负责将泛素偶联到底物蛋白上[4]。研究发现Ataxin-3 C端的三个UIMs(UIM1,UIM2,UIM3)可能与Parkin N端的Ubl相互作用,作为一种去泛素化酶发生相反的作用,可去除泛素[5]。最近的研究显示,p53是ATX-3的一种新型底物,AT3通过泛素(Ub)-蛋白酶体途径抑制p53降解,具有稳定p53的作用,进而调节细胞凋亡的作用[6],但是AT3调节p53的机制还未阐明。AT3能与人类同源酵母蛋白RAD23、hHR23A和hHR23BUBL相互作用,hHR23通过靶向蛋白酶体的泛素化核苷酸切除修复因子XPC/Rad4参与核苷酸切除修复通路,以及将泛素化底物向蛋白酶体递送降解[7]。
AT3在细胞内是否必须存在可能还有争议,在一项实验中,培养的非神经元人和小鼠细胞中,使用小干扰RNA (small-interference RNA,siRNA)耗尽AT3可导致胞浆内泛素化物质积累、细胞骨架紊乱、细胞黏附丧失和细胞死亡增加[8],同时研究发现在体外培养的细胞中,AT3与E3泛素连接酶芯片(E3 ubiquitin ligase CHIP)的协同作用下能辅助靶向降解芯片底物[9]。但不同的是[10],果蝇CHIP对AT3在果蝇眼中的保护功能是不需要的,据此推断CHIP可能不是唯一在体内泛素化Ataxin-3的E3泛素连接酶。而在另一项研究中,将编码短发夹RNA (shRNA)的慢病毒注射入野生型大鼠的大脑,局部敲除内源性AT3并没有显示出任何毒性[11]。, http://www.100md.com(王兴枝子 龙喜带)
【关键词】 Ataxin-3;泛素蛋白酶体系统;聚谷氨酰胺;3型脊髓小脑共济失调
中图分类号:R392.12 文献标志码:A DOI:10.3969/j.issn.1003-1383.2019.09.001
Ataxin-3(AT3,ATXN3)作为一种重要的去泛素化酶在国外已经广泛研究,在国内受到的关注也越来越多,本文就AT3的机制和与它相关的疾病进行综述,着重介绍它的基因表达水平和蛋白结构功能,以此更深入了解它与其他疾病潜在的机制。
1 Ataxin-3基因与表达
ATXN3基因位于染色体14q32.12上,包含了13个外显子,并能选择性剪接不同的蛋白亚型,在血液中已经鉴定出56种ATXN3的剪接体,其中20种可能被翻译成功能性Ataxin-3蛋白[1]。最近研究指出三种结构不同的剪接体[2],分别为Ataxin-3a和Ataxin-3c,还有一个是由Ataxin-3a的C端的外显子10终止单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNP)造成的,导致过早终止密码子突变,因此产生了两个亚型:Ataxin-3aL(长)和Ataxin-3aS(短),这3种不同的剪接体的差异主要表现在羧基末端序列上的不同。
2 Ataxin-3蛋白结构与功能
人类Ataxin-3蛋白是在全身细胞中广泛表达,据报道[2]最长的剪接体AT3有376个氨基酸,分子量约为42 kDa。在结构上,AT3由一个球状的去泛素化N端Josephin结构域(JD)、一个的灵活的C端尾部、C端的两个相互作用的泛素基序(Ubiquitin-interacting motifs,UIMs,也叫LALAL motifs和PUBs)和多谷氨酰胺(Polyglutamine,polyQ)区域构成。其中N端JD位于第1~170位氨基酸上,UIMs在第223~240和243~260位氨基酸上,多谷氨酰胺region在第296~317位氨基酸上。还有一种较短的AT3剪接变体含有373个氨基酸,不同的是在C端含有第三个UIM,这个UIM在第334~351位氨基酸上。此外,在polyQ伸展端(第283~285位氨基酸)的上游发现了一个高度保守的核酸的定位信号(nuclear localization signal,NLS),包含有17个残基,位于第296~312位氨基酸。在这个NLS结构前有一个潜在的酪蛋白激酶Ⅱ(CK-Ⅱ)磷酸化位点(TSEE),位于第277~280位氨基酸,该位点可能与AT3进入细胞核的速度相关。而在JD之后有一个核酸输出信号(a nuclear export signal,NES)位于第174~183位氨基酸上。除此之外,Ataxin-3还包含一些保守序列。这些区域有些已经被研究出具有重要的功能,有些区域可能具有潜在的功能还未被研究出。
不同的Ataxin-3亚型在生理水平上存在差异[2],首先,这三种不同亚型的半衰期存在着差异,Ataxin-3aS的半衰期(12 h)比Ataxin-3c(24 h)和Ataxin-3aL(26 h)要短,降解更快。其次,这三种不同的亚型途径降解存在着差异,Ataxin-3c和Ataxin-3aL是通过自噬(Bafilomycin A1)降解的,而Ataxin-3aS则是通过自噬和蛋白酶体途径降解的,这一点也可以解释Ataxin-3aS半衰期的差异。最后,各亚型的结构和定位不尽相同,Ataxin-3aL和-3aS的C端为疏水性,而Ataxin-3c的C端为亲水性,含有第三个UIM。
从功能上来讲,AT3是一种自发表达的去泛素化酶,在蛋白酶体蛋白降解途径和转录调控中具有重要作用,直接调控泛素-蛋白酶体机制[3]。泛素-蛋白酶体系统(ubiquitin proteasome system,UPS)在真核细胞过程中起着关键的调节作用,包括细胞周期进展、应激反应、信号转导、转录激活和DNA修复。泛素化蛋白水解途径的作用机制是将蛋白导向蛋白酶体降解,清除多余蛋白,維持细胞蛋白正常水平。泛素活化酶(E1)、泛素偶联酶(E2)、泛素连接酶(E3)三种蛋白串联,共价将蛋白泛素连接到底物上,构建蛋白酶体识别所需的多聚泛素链。Parkin是一种环间E3连接酶,负责将泛素偶联到底物蛋白上[4]。研究发现Ataxin-3 C端的三个UIMs(UIM1,UIM2,UIM3)可能与Parkin N端的Ubl相互作用,作为一种去泛素化酶发生相反的作用,可去除泛素[5]。最近的研究显示,p53是ATX-3的一种新型底物,AT3通过泛素(Ub)-蛋白酶体途径抑制p53降解,具有稳定p53的作用,进而调节细胞凋亡的作用[6],但是AT3调节p53的机制还未阐明。AT3能与人类同源酵母蛋白RAD23、hHR23A和hHR23BUBL相互作用,hHR23通过靶向蛋白酶体的泛素化核苷酸切除修复因子XPC/Rad4参与核苷酸切除修复通路,以及将泛素化底物向蛋白酶体递送降解[7]。
AT3在细胞内是否必须存在可能还有争议,在一项实验中,培养的非神经元人和小鼠细胞中,使用小干扰RNA (small-interference RNA,siRNA)耗尽AT3可导致胞浆内泛素化物质积累、细胞骨架紊乱、细胞黏附丧失和细胞死亡增加[8],同时研究发现在体外培养的细胞中,AT3与E3泛素连接酶芯片(E3 ubiquitin ligase CHIP)的协同作用下能辅助靶向降解芯片底物[9]。但不同的是[10],果蝇CHIP对AT3在果蝇眼中的保护功能是不需要的,据此推断CHIP可能不是唯一在体内泛素化Ataxin-3的E3泛素连接酶。而在另一项研究中,将编码短发夹RNA (shRNA)的慢病毒注射入野生型大鼠的大脑,局部敲除内源性AT3并没有显示出任何毒性[11]。, http://www.100md.com(王兴枝子 龙喜带)