基于生物信息学分析CISD2在肝细胞癌中的表达意义及功能网络关系(3)
1.5统计学方法所有的数据分析均采用网页以及软件自带的数据分析功能进行统计学分析,检验水准为α=0.05。
2结果
2.1生物信息学分析CISD2与HCC患者的预后相关性结果
生物信息学分析表明,CISD2的mRNA表达水平与HCC患者的总体5年生存率相关(P=0.041)。见图1。其中CISD2 mRNA高表达患者的5年中位生存时间为36个月,CISD2 mRNA低表达患者的5年中位生存时间为45个月,研究结果表明CISD2 mRNA高表达提示HCC患者预后较差。
2.2CISD2与免疫浸润含量分析
肿瘤免疫微环境由肿瘤细胞、间质细胞和浸润免疫细胞组成。我们利用TIMER初步探究了CISD2表达与免疫细胞浸润的潜在联系。结果表明,CISD2与B细胞(P=5.44E04)、CD4+T细胞(P=3.94E06)、CD8+T细胞(P=2.90E03)、巨噬细胞(P=9.22E07)和树突状细胞(P=3.19E04)的浸润有关联,且都呈负相关。见图2。
2.3生物信息学分析CISD2的PPI互作网络及GO富集结果
网页工具STRING进行PPI分析,发现SFXN4、COX4I1、WFS1、GIMAP5、TSFM、MRFAP1、CISD3、MTPAP、OPA3、SOD1 共10个基因与CISD2相互作用最为密切 ......
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