当前位置: 首页 > 期刊 > 《右江医学》 > 2023年第2期
编号:23078
基于生物信息学分析TGFBI基因在头颈部鳞癌中的表达及其预后意义
http://www.100md.com 2023年6月25日 2023年第2期
     胡婷 卢诗丽 李钰颖 刘洁兰 侯沅林 莫丽梅 唐玉莲

    【摘要】 目的 探讨转化生长因子β诱导基因(transforming growth factor β-induced gene, TGFBI)在头颈部鳞癌(head and neck squamous carcinoma,HNSC)中的表达及其预后意义。

    方法 首先通过TIMER2.0数据库分析TGFBI基因在泛癌中的表达水平;并进一步利用UALCAN数据库和GEPIA数据库检索TGFBI基因在HNSC与正常组织中的表达水平,以及TGFBI基因与患者种族、年龄、性别、肿瘤分期、淋巴结转移状况等相关临床特征的关系;通过STRING数据库分析TGFBI基因的互作蛋白,借助DAVID数据库对其与互作蛋白基因进行功能富集分析;最后通过GEPIA数据库分析TGFBI基因在HNSC中的生存意义。

    结果 发现TGFBI在HNSC中的表达明显高于正常组织(P<0.05),TGFBI高表达的患者总生存期明显低于低表达的患者(P<0.05)。蛋白互作分析发现,FN1、MMP14、ITGA3、ITGAM、ITGAV、ITGB1、ITGB2、ITGB3、TGIF2和TGIF2LX这10个蛋白基因与TGFBI存在紧密联系,此外,TGFBI及相关基因功能富集分析显示它们主要参与了5个生物学程序、4个细胞组分、3个分子功能、4個信号通路。

    结论 TGFBI在HNSC中的表达水平较正常组织明显升高,且与患者预后不良有关,有望成为HNSC诊断和治疗的生物学靶点。

    【关键词】 转化生长因子β诱导基因;头颈部鳞癌;生物信息学;预后

    中图分类号:R739.6? 文献标志码:A? DOI:10.3969/j.issn.1003-1383.2023.02.002

    Analysis of expression of TGFBI gene in head and neck squamous cell carcinoma and its prognostic significance based on bioinformatics

    HU Tinga, LU Shilib, LI Yuyingb, LIU Jielanb, HOU Yuanlinb, MO Limeia, TANG Yulianb

    (a. School of Clinical Medicine, b. School of Laboratory Medicine, Youjiang Medical University for Nationalities ......

您现在查看是摘要页,全文长 17038 字符