联合利用AFP进行HCC的诊断与利用其高表达的特异性构建HCC的多种治疗方案虽然取得了很大的进展，但其方法仍有一定的不完善性。如有部分正常肝细胞，特别是肝细胞也表达一定量的AFP。因此，在利用相关技术时可能会对这些人体正常细胞造成一定杀伤性。且在与HBV或HCV无关的HCC中AFP并不是一个敏感的指标Ⅲ；又近年来发现血清中AFP浓度与HCC 表达有时不呈正相关性，因此在联合诊断与治疗时又造成对HCC估计的不准确性，这也在一定程度上限制了相关技术的使用范围。另外,能否通过影响降低AFP的血清浓度或通过外援性AFP增加其血清浓度达到与TNFa的协调作用促进癌细胞的凋亡来治疗HCC还有待于研究，且目前所做的这些治疗性实验都处于实验动物阶段 ......