在09年大张旗鼓的进行医改后，国家承诺拿出8500亿进行医疗体制的保障，但是没有提及多大的份额用于对国家医院进行医药分家的补偿，如何补偿，如何界定补偿的力度是医药分家的一个核心内容，在剥离药品收入医院如何生存这个严峻的问题背后，建立国家补偿机制是一个先决条件。

    3.3来自医院内部的阻力

    医药分家会触动一部分人员的经济利益，会遇到来自医疗机构领导、医生和药房等各类人员的阻力，给医药分家埋下不稳定因素。我国长期实行的公费医疗和劳保制度已经造成了不科学的就医用药习惯，患者在医院就医买药已经成为一种惯性行为。医院药房工作人员的社会化分流也是一项艰难的课题。

    3.4医药分家实际操作困难

    实现医药分家，实际操作模式的探讨也将是一个长期的过程，韩国在医药分家后，韩国在实行医药分家后，医疗费用非但没有减少，反而大幅增加，与期望大相径庭[5]。一般来说，医药分家不包括门诊的输液，但这会不会成为医院滥用抗生素，大量给病人输液的一个借口和动力？还有我国药剂师严重不足 ......