ITS2序列鉴定临床分离丝状真菌
内部转录间隔区,测序
【摘 要】目的:建立以ITS2为靶序列鉴定临床分离丝状真菌的分子生物诊断方法。方法:利用通用引物扩增真菌核糖体转录间隔区2(ITS2),对PCR产物进行测序,在GenBank中对测序结果进行Blastn等分析。结果:9株真菌测序结果与表型鉴定符合,鉴定出7株临床分离丝状真菌。结论:ITS2测序可以作为临床丝状真菌的分子生物学诊断方法之一。【关键词】丝状真菌; 内部转录间隔区; 测序
【中图分类号】R446.5 【文献标识码】A 【文章编号】1004—7484(2013)11—0043—02
随着免疫抑制剂、广谱抗生素的广泛应用以及临床侵入性诊疗技术的广泛开展,临床深部真菌感染病例增多,尤其是丝状真菌引起的感染,对该类疾病的早期诊断对抗真菌治疗效果相当关键[1]。丝状真菌采用传统的形态学检查,需要丰富的经验,而且耗时较长,不利于临床的快速、准确诊断。随着分子生物学技术的飞速发展,人们发现真菌的5.8S rRNA基因和28S rRNA基因具有保守序列,它们之间的ITS2序列为可变区,具有属种差异[2]。本研究建立以ITS2为靶序列鉴定临床分离丝状真菌的分子生物诊断方法。
1 材料和方法
1.1真菌菌株 本院微生物室和皮肤科实验室保存的真菌菌株 ......
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