真核生物中DNA6-甲基腺嘌呤检测方法及与癌症的关系(2)
2.3 高效液相色谱?-质谱联用(HPLC-MS/MS)基于抗体的检测方法和基于限制性内切酶的检测方法只能检测6mA的有无以及在不同细胞及组织中的相对含量,不能得到6mA在DNA中的绝对含量,HPLC-MS/MS则能准确定量6mA。将提取出来的DNA样品经过DNA核酸酶及碱性磷酸酶等切成单个核苷,不同的核苷由于极性不同在高效液相色谱中分开,同时两次质谱通过特定的母离子、子离子进一步确定核苷,最后根据离子强度对特定核苷进行定量。目前HPLC-MS/MS能灵敏的检测低至1 fmol的6mA,用较少的样本准确测定6mA的绝对含量。此方法操作简单,灵敏度高,准确定量,但不能提供6mA在基因组上的位置信息。
2.4 单分子实时测序(SMRT)
SMRT是PacBio公司推出的单分子实时测序技术 ......
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