不同中医证型原发性失眠患者肠道菌群差异研究(3)
Alpha多样性反映单个样品的物种多样性,包括observed species指数、chao1指数、PD whole tree指数等[10]。observed species和chao1指数反映样品中群落的丰富度(species richness),如样品中物种多样性较高,显示较多未被测序检测到的物种。Shannon指数、simpson指数反映的是群落的多样性(species diversity)。PD whole tree指数反映了样品中物种对进化历史保存的差异,PD whole tree指数越大说明物种对进化历史保存的差异越大。4组间诸种指数差异不明显(P>0.05)。见表1。2.2 基因序列分类单元分析
OTUs的丰度初步说明了样品的物种丰富程度。kruskal.test检验提示肝郁化火组、阴虚火旺组样本的mapped reads较心脾两虚组、对照组多(P<0.05),说明前2组具有更多的物种多样性,见表2。本研究共得到1226个不同的OTUs,4组差异有统计学意义的OTUs有180个(P<0.05) ......
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