3.4 三叶青根和茎叶中差异表达基因的COG注释

    利用COG数据库对基因产物进行直系同源分类，共得到16 152条三叶青Unigene的同源序列，共分为25个类别。其中与生物过程相关的Unigene最多，有6526条，占40.41%，包括复制、重组和修饰(1125条，6.97%)，转录(563条，3.48%)和信号传导(396条，2.45%)；与功能预测类别相关的Unigene基因有2541条，占15.73%；此外，与代谢相关的Unigene基因数量为1548条，占总Unigene数量的9.58%。将三叶青根和茎叶中差异表达的基因比对到COG数据库进行注释，结果见图1。

    3.5 三叶青根和茎叶中差异表达基因的生物学代谢KEGG分析

    根据KEGG数据库的注释信息进一步将三叶青Unigene进行pathway注释，其中有14 511条Unigene获得对应的Ko编号，大于2%注释基因比例的10条代谢途径见表2 ......