当前位置: 首页 > 期刊 > 《中国中医药信息杂志》 > 2018年第9期
编号:13278633
“基因—体质—疾病”关联模式下4种中医体质差异表达基因富集分析(2)
http://www.100md.com 2018年9月1日 《中国中医药信息杂志》 2018年第9期
     1 资料与方法

    1.1 数据来源及筛选

    计算机检索中國知识资源总库(CNKI)、中国学术期刊数据库(万方数据),以主题词“体质”“基因表达谱”进行模糊检索,检索范围均从建库至2016年12月31日。对结果逐一仔细阅读,同时满足下列标准予纳入:①实验样本符合9种体质分类及判定标准[1]。②以偏颇体质为实验样本,平和体质为对照样本,样本量不小于3。③取样于人体外周血液且应用芯片技术检测基因表达谱。④文献结果中明确报道偏颇质相对于平和质样本的差异表达基因。

    1.2 数据提取

    对文献中4种偏颇体质差异表达的基因进行提取收集,以基因列表(gene list)形式分别保存于独立的文本文件中,基因列表格式:gene1,gene2,gene3...。如某种体质差异表达基因结果在文献中以芯片ID形式报道,需对芯片ID进行转换,找出该芯片参考资料,将芯片ID转化为对应的正式基因符(official gene symbol),如ID(211300_s_at)→gene symbol(TP53)。最后对所获得的每种体质差异表达基因去冗处理。

    1.3 数据分析

    采用DAVID数据库(https://david.ncifcrf.gov/)对收集的4种体质差异表达基因进行富集分析 ......
上一页1 2 3下一页

您现在查看是摘要页,全文长 4878 字符