“君臣佐使”是中药复方最常用的配伍规律之一，网络药理学可对该类规律在一定程度上进行阐述和解释。韩彦琪等[19-20]对元胡止痛滴丸中28个入血成分进行靶点筛选和通路分析，發现君药延胡索通过中枢镇痛、解痉等通路起到止痛、理气、活血等功效，白芷作为臣药通过解痉、炎症等通路起到宣湿痹行气血功效，符合中药复方配伍观念。Tao等[4]通过建立郁金方成分-靶点网络，证实含有效成分及靶点最多的郁金作为君药起主要作用，并且方中每种药物在治疗心脑血管疾病中起到减毒增效作用，印证方剂中“君臣佐使”的组方规律。

    2.2 “药对”配伍作用

    方剂配伍中，将固定两味药作为药对，通过七情和合、性味功效等原则配伍组合，多数起到增效或减毒的作用。药对成分相对较为简单，容易排除干扰，明确靶点和通路，网络药理学在药对作用机制研究过程中具有独特优势。许海燕等[21]对柴胡-黄芩协同治疗糖尿病作用机制进行网络药理学研究，得到黄芩主要通过黄酮类成分与蛋白PPAR-γ及GSK-3β结合治疗糖尿病，柴胡通过其中皂苷类成分起到增效作用。刘夫艳等[22]对黄芪-莪术抗大肠癌分子机制进行研究 ......