研究团队不断改进技术方法，高质量完成了112例新冠病毒基因组测序、组装和解析。基于病毒基因组序列的进化树分析发现，hCoV-19主要有两个分支(CladeⅠ和CladeⅡ)。已确认有华南海鲜市场接触史的6例患者均集中在其中一个分支中(CladeⅠ)，而CladeⅡ患者无该接触史，提示COVID-19疫情的发生并不局限于华南海鲜市场。通过对疫情暴发的不同时间阶段和不同区域患者的hCoV-19基因序列(截至2020年3月初)变异特征的比较分析，从上海病例分离的病毒基因组中识别了169个碱基改变，其重复出现的突变与已公布的病毒序列一致，呈现较为稳定的进化过程，提示该病毒可能在疫情早期就已适应在人类宿主中传播。同时发现，hCoV-19两个分支的传播性、致病性和临床表现等方面无显著差异，未发现与COVID-19重症患者有显著相关的病毒变异序列。从临床和免疫学研究发现，COVID-19患者淋巴细胞明显减少，尤其是重症患者CD4+和CD8+T细胞呈显著进行性下降趋势，且炎性细胞因子IL-6和IL-8明显增高。COVID-19疾病发展严重程度的决定因素主要与患者年龄、基础疾病及淋巴细胞减少和相关的细胞因子风暴密切相关 ......