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编号:13676253
先天性心脏病永生性基因库的建立和相关基因研究(2)
http://www.100md.com 2014年6月18日 杨威 董啸 周建良 龚艺 徐建军
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    参见附件。

     2.3筛选差异表达miRNA调控的差异基因 芯片分析得到的差异miRNA和差异表达基因,结合从TargetScan收集的调控对,得到了hsa-miR-124调控的34个差异表达基因,hsa-miR-138调控的LMAN1和LYPLA1这2个差异表达基因。

    2.4构建共表达网络 所有筛选得到的差异表达的基因中,除了hsa-miR-124调控的34个和hsa-miR-138调控的2个差异表达基因外,可能会存在这两个miRNA间接调控的差异表达基因。因此,利用string计算875个差异基因之间的共同表达系数,筛选共表达系数>0.5的作用对,最终得到231对共表达作用对。结合miRNA调控关系构建miRNA调控靶基因的网络,如图1。由图可见,除了已知的受到两个miRNA调控的差异表达基因外,仍有13个基因受到间接调控。

    2.5共表达网络中基因功能的研究:将网络中的所有基因利用DAVID进行富集分析,筛选p value<0.05且count>2,得到基因富集的功能簇14个,其中最为显著的功能为蛋白质定位,见表1。

    3 讨论

    法洛四联症(TOF)是一种严重的先天性心脏病,发病率位于发绀型先天性心脏病之首。手术难度大,死亡率高,并发症发生率高[12]。有文献报道,婴幼儿TOF的手术死亡率也在0%~5%之间[13]。TOF疾病常见的其它畸形有:多发性室间隔缺损、周围肺动脉狭窄、冠状动脉畸形、右位主动脉弓、动脉导管未闭、房间隔缺损、左上腔静脉缺如等[2]。

    近年来,随着对TOF病理改变的理解越来越深刻,以及要幼儿TOF手术的开展,TOF根治术的成功率有明显的提高,但受多种因素的影响,手术仍有一定的风险 ......

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