基于GROMACS的分子动力学模拟的研究(4)
[12] E. Lindahl， B. Hess， D. van der Spoel， Gromacs 3.0： A Package for Molecular Simulation and Trajectory Analysis[J].Journal of Molecular Modeling，2001， 7(8)： 306-317.
[13] D. A. Case， T. E. C. III， T. Darden， H. Gohlke， et al. Woods， The Amber Biomolecular Simulation Programs.[J].Journal of Computational Chemistry，2005， 26(16)： 1668-1688.
[14] Oostenbrink C， Villa A， Mark A E， et al. A biomolecular force field based on the free enthalpy of hydration and solvation： The GROMOS force‐field parameter sets 53A5 and 53A6[J]. Journal of computational chemistry， 2004， 25(13)： 1656-1676.
[15] L. Kale， R. Skeel， M. Bhandarkar， R. Brunner， A. Gursoy， N. Krawetz， J. Phillips， A. Shinozaki， K. Varadarajan， K. Schulten， Namd2： Greater Scalability for Parallel Molecular Dynamics[J].J Comput Phys， 1999， 151： 283-312.
[16] W.Humphrey， A. Dalke， K. Schulten， Vmd： Visual Molecular Dynamics[J]. J Mol Graph，1996， 14(1)： 33-38.
[17] Chipot C.， Pohorille A. Free energy calculations： theory and applications in chemistry and biology[M]. Springer， 2007.
编辑/成森, 百拇医药(江建敏 李娟 方慧生)
[13] D. A. Case， T. E. C. III， T. Darden， H. Gohlke， et al. Woods， The Amber Biomolecular Simulation Programs.[J].Journal of Computational Chemistry，2005， 26(16)： 1668-1688.
[14] Oostenbrink C， Villa A， Mark A E， et al. A biomolecular force field based on the free enthalpy of hydration and solvation： The GROMOS force‐field parameter sets 53A5 and 53A6[J]. Journal of computational chemistry， 2004， 25(13)： 1656-1676.
[15] L. Kale， R. Skeel， M. Bhandarkar， R. Brunner， A. Gursoy， N. Krawetz， J. Phillips， A. Shinozaki， K. Varadarajan， K. Schulten， Namd2： Greater Scalability for Parallel Molecular Dynamics[J].J Comput Phys， 1999， 151： 283-312.
[16] W.Humphrey， A. Dalke， K. Schulten， Vmd： Visual Molecular Dynamics[J]. J Mol Graph，1996， 14(1)： 33-38.
[17] Chipot C.， Pohorille A. Free energy calculations： theory and applications in chemistry and biology[M]. Springer， 2007.
编辑/成森, 百拇医药(江建敏 李娟 方慧生)