甲状腺癌中miR-222关键靶基因预测及其信号通路分析
AGTR1,生物信息学
摘要:目的 利用生物信息学技术预测人类miR-222的靶基因,并分析其可能参与甲状腺癌的生物学过程和信号通路。方法 通过TCGA数据库研究miR-222的表达与甲状腺癌的关系,然后TCGA中表达下调的基因和网站预测的miR-222靶基因进行取交集得到重叠基因,再进行生物信息学分析确定与甲状腺癌相关的关键miR-222靶基因和通路,最后通过GEPIA对靶基因进行表达验证以及miR-222和靶基因的相关性分析。结果 miR-222在甲状腺癌中表达上调,富集分析表明miR-222很有可能参与血管紧张素受体-配体结合的调节,其中一个可能的靶基因是AGTR1,其在甲状腺癌中表达下调,与miR-222的表达呈负相关。结论 上调的miR-222可能以AGTR1为靶标,从而调节甲状腺癌中血管紧张素受体-配体结合发挥作用。关键词:甲状腺癌;miR-222;AGTR1;生物信息学
中图分类号:R736.1 文献标识码:A DOI:10.3969/j.issn.1006-1959.2020.01.026
文章编号:1006-1959(2020)01-0085-04
Prediction of Key Target Genes of miR-222 in Thyroid Cancer and Analysis of Its Signal Pathway
HUANG Qi-feng1 ......
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