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编号:13517001
影响前列腺癌风险的关键基因识别(1)
http://www.100md.com 2020年1月15日 《医学信息》 20202
影响前列腺癌风险的关键基因识别,基因差异表达分析,生物信息学,富集分析
     摘要:目的 基于TCGA数据库筛选影响前列腺癌(PCa)风险水平的关键基因,并建立PCa患者生存风险预测模型。方法 从TCGA数据库下载PCa患者基因表达数据及相关临床数据,通过前期研究初步筛选基因,并将患者分为高、低风险两类;对基因进行差异表达分析和GO和KEGG通路富集分析,筛选相关基因和信号通路;对差异表达基因进行蛋白互作网络分析,标记出关键基因;将关键基因的表达数据与PCa患者生存时间纳入Cox回归分析,建立生存风险预测模型。结果 前期研究得到620个基因,高风险患者234例,低风险患者285例;差异表达分析获得30个基因,主要分子功能(MF)为:受体结合和生长因子活动,生物学过程(BP)主要为细胞-细胞信号传导、细胞增殖的积极调节、血管生成的调节和细胞表面受体信号通路 ......
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