Key words：Alveolar lavage fluid;High-throughput sequencing;Pulmonary infection;Etiology

    肺部感染(pulmonary infection)是指包括终末气道、肺泡腔及肺间质在内的肺实质炎症，病因以感染最为常见，还可由理化、免疫及药物引起，其临床表现、影像学及感染的病原体种类均存在多样性，往往不能通过一些常见的辅助检查和临床表现来确定感染的病原体。当肺部感染的病原体诊断不够明确时，尤其是重症患者，如不能够针对性的采取药物进行治疗，则可能耽误病情，导致治疗不及时引起死亡[1]。此外，临床上以渗出或实变为表现的肺部非感染性疾病越来越多见，如肺炎型肺癌、放射性肺炎、肺栓塞等，临床诊治困难。近年来，高通量测序技术，又称二代测序技术，可以实现在短时间内对一个物种的基因组、转录组和宏基因组进行深入全面的分析，通过序列分析掌握病原微生物群体组成情况。与传统病原检测方法相比，高通量测序技术能够一次性检测获得样品中可能感染的多种病原物基因组序列，对明确混合感染以及少见、罕见或新发病原体感染具有独特优势[2] ......