线粒体和核基因密码子的若干统计特征及其关联
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袁哲明 王智 张永生 吉洪湖 欧阳芳 文迪彪 湖南农业大学生物安全科技学院 湖南文理学院生命科学系 湖南农业大学生物安全科技学院 湖南农业大学生物安全科技学院 湖南农业大学生物安全科技学院 湖南农业大学生物安全科技学院
【摘要】基于归1000密码子使用频次,从垂直和水平两个方向比较研究了不同进化阶层生物线粒体基因和核基因密码子使用的若干统计特征及其关联.结果表明:线粒体基因密码子多样性、相对分子质量和相对π电子共振能低于相应核基因且变异较大;不同进化阶层生物线粒体基因和核基因归1000密码子的相对π电子共振能呈极显著负相关且两者之和接近定值;真菌-真菌线粒体、植物-植物线粒体、无脊椎动物-无脊椎动物线粒体的密码子使用频次匹配较好;线粒体基因AU含量、密码子第三位碱基AU3s含量高于相应核基因;给出了密码子各位点碱基含量随进化以及在线粒体-核间的变化规律.由于线粒体环境不如核环境稳定,线粒体基因密码子的多个统计特征较核基因在不同进化阶层生物间变异较大,但二者在归1000密码子相对π电子共振能等若干特征方面仍存在明显关联.
【关键词】 线粒体基因 核基因 密码子使用 关联
【基金】国家自然科学青年基金资助项目(30100122)
【分类号】Q75
线粒体是真核生物的一个重要细胞器,它是细胞活动所需的“能量中心”.迄今为止,已有605种生物的线粒体完成了全基因组测序,并对不同进化阶层生物线粒体基因组的组织结构、遗传特性、线粒体基因所引起的疾病、衰老、细胞凋亡、育性调控等进行了研究犤1～5犦.线粒体基因组、编
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摘 要：基于归1000密码子使用频次，从垂直和水平两个方向比较研究了不同进化阶层生物线粒体基因和核基因密码子使用的若干统计特征及其关联.结果表明：线粒体基因密码子多样性、相对分子质量和相对π电子共振能低于相应核基因且变异较大； 不同进化阶层生物线粒体基因和核基因归1000密码子的相对丌电子共振能呈极显著负相关且两者之和接近定值；真菌—真菌线粒体、植物—植物线粒体、无脊椎动物—无脊椎动物线粒体的密码子使用频次匹配较好；线粒体基因AU含量、密码子第三位碱基AU3s含量高于相应核基因;给出了密码子各位点碱基含量随进化以及在线粒体—核间的变化规律.由于线粒体环境不如核环境稳定，线粒体基因密码子的多个统计特征较核基因在不同进化阶层生物间变异较大， 但二者在归1000密码子相对π电子共振能等若干特征方面仍存在明显关联.
关键词：线粒体基因；核基因；密码子使用；关联
中图分类号：Q61
文献标识码：A
文章编号：1007—7847(2005)02-0110—08
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