小鼠肝质膜蛋白质的生物信息学研究
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刘珍 张丽军 谢锦云 梁宋平 湖南师范大学生命科学学院 湖南师范大学生命科学学院 湖南师范大学生命科学学院 湖南师范大学生命科学学院
【摘要】随着高通量蛋白质组研究技术的发展,使用生物信息学方法对鉴定出的蛋白质进行批量的物理化学性质和功能属性的研究显得越来越重要.对2-DE分离的小鼠肝质膜中鉴定的209个蛋白质运用生物信息学方法进行了一系列的功能属性分析,包括统计分析ProtParam软件计算出的209个蛋白质的理论相对分子质量、等电点以及疏水值的分布情况,使用TMHMM预测蛋白质的跨膜区数目,运用系统发生谱方法预测蛋白质相互作用网络,根据其相互作用网络预测部分未知蛋白质的功能.
【关键词】 生物信息学 物理化学性质 蛋白质相互作用 功能预测
【基金】国家973项目(2001CB5120) 国家自然科学基金资助项目(30000028) 国家自然科学基金资助项目(30240056)
【分类号】Q51
蛋白质组学研究旨在阐明生物体内全部蛋白质的表达模式和功能模式.其研究包括鉴定蛋白质的表达、存在方式、结构、功能及相互作用等.关于蛋白质的功能,目前主要是通过大量的分子生物学及生物化学的研究技术和方法获得的.但这种研究手段不能满足蛋白质组研究的高通量要求.因此
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摘 要：随着高通量蛋白质组研究技术的发展，使用生物信息学方法对鉴定出的蛋白质进行批量的物理化学性质和功能属性的研究显得越来越重要。对2-DE分离的小鼠肝质膜中鉴定的209个蛋白质运用生物信息学方法进行了一系列的功能属性分析， 包括统计分析ProtParam软件计算出的209个蛋白质的理论相对分子质量、等电点以及疏水值的分布情况，使用TMHMM预测蛋白质的跨膜区数目，运用系统发生谱方法预测蛋白质相互作用网络，根据其相互作用网络预测部分未知蛋白质的功能。
关键词：生物信息学；物理化学性质；蛋白质相互作用：功能预测
中图分类号：Q501；Q502
文献标识码：A
文章编号：1007—7847(2005)04—0313—06
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