Heka细胞导入TRIM45基因后的比较蛋白质组学研究(2)
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误差为±50μg/g,肽片段以正离子形式存在,半胱氨酸为脲甲基半胱氨酸(Carbamidomethyl-Cys),每个肽片段允许有2个不完全裂解位点,半胱氨酸可能以丙酰胺-半胱氨酸的形式存在,最少匹配的肽片段为4,甲硫氨酸以氧化态存在。
2 结果
2.1 双向电泳图谱
通过2D技术分离得到两组样品的全蛋白质图谱,每组中选取3次重复性好的图谱用PDQuest7.2软件进行匹配分析,发现其中有15个显著性的差异蛋白质点(见图1、表1)。
2.2 差异蛋白质点的MALDI-TOF-MS肽质量指纹图谱分析
切取平行胶上15个相应的差异蛋白质点,经胶内原位酶解后进行MALDI-TOF-MS肽质量指纹图谱测定,并以酶自动降解峰(m/z=1993.9772)进行校正。选取3对重复性好的图谱,用PDQuest7.2软件分析,选取2倍以上的差异点进行酶解鉴定,所鉴定到15个差异点见表1。图2为蛋白质点的肽质量指纹图谱。
3 讨论
为了研究TRIM45基因的功能,本文比较了转入空载体和TRIM45重组载体的Hela细胞的全蛋白双向凝胶电泳图谱,分析鉴定获到了15个与TRIM45基因表达相关的差异蛋白质,以转入空载体的Hela细胞的蛋白图谱为空白对照,得到了8个上调点和7个下调点。
上调的蛋白质中,26S蛋白酶的亚基6A(26S protease regulatory subunit 6A)是人红血球中26S蛋白酶的一个组成部分,26S蛋白酶主要参与泛素化蛋白质的ATP依赖性降解 ......
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