一种MicroRNA dupkex设计新技术研究(1)
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摘 要：利用micmRNA数据库，获取3种微RNAmir-181a、mir-124和mir-1的成熟序列信息。基于siRNAdu-plex在形成RNA诱导的沉默复合物(RNA-induced silencing complex，RISC)过程中的不对称性的特点，初步设计了针对上述3种微RNA的microRNA duplex。采用生物学软件Oligo6.0分别评价其热动力学特性，并通过改变反义链3’端个别碱基序列使其满足热动力学的需求，从而确定最终的设计序列。结果显示，利用RISC形成过程的不对称性，结合生物学软件Oligo6.0的热动力学分析来设计mjRNA duplex，是一种简便可行、准确有效的方法。
关键词：微RNA；siRNA；生物信息学分析；热动力学性质
中图分类号：0522；Q751
文献标识码：A
文章编号：1007—7847(2006)02—0109-04
微RNA(microRNA，miRNA)是一类长约为22nt的非编码小分子单链RNA，在动物体内，它可以通过与对应的靶序列发生不完全互补配对，从而抑制特异性的mRNA的翻译，导致相应蛋白质合成减少。随着分子克隆技术和生物信息学的不断进步，科学工作者们已经从不同物种中发现了大量的miRNA，至今已经确定的人类miRNA有222个，约占人类全基因组的1%左右，但它们却调控了20%甚至更多的基因编码产物。
大量的研究表明，微RNA可能在人类发育调控、细胞增殖和死亡、造血过程等多种生物学过程中发挥重要的作用。然而，在动物体内，绝大多数的微RNA的具体功能仍然不清楚，这主要是由于miRNA靶基因识别存在一定的困难。在植物中，miRNA与靶序列发生近似完全互补，因而可以直接利用生物信息学的方法进行预测 ......
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