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编号:11608468
拟南芥AtMGT3基因转运功能研究(2)
http://www.100md.com 2007年12月1日 《生命科学研究》 2007年第4期
拟南芥AtMGT3基因转运功能研究

     制打下基础,以上还只是Mg2+转运机制的初步研究,Mg2+转运基因家族的转运机制,以及在植物体内的生物学功能,尚需更进一步的研究。

    1 材料和方法

    1.1 菌株的生长条件

    E.coli DH5a在37℃,LB培养基中生长,并添加相应抗生素,S.typhimurium MM281需要高浓度Mg2+才可以生长,它被用于功能互补实验,于37℃,Mg2+(以MgS04的形式添加)终浓度为100mmol/L,氯霉素浓度为34mg/L的LB或N-minimal培养基中生长。

    1.2 载体、酶类及各种试剂盒

    pMDl8-T载体和实验中用到的所有酶类均购自大连宝生物工程有限公司,质粒纯化及胶回收试剂盒购自长沙安比奥生物技术公司,pTrc-99A由本室保存。
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    1.3 AtMGT3基因的克隆及载体构建

    拟南芥基因组DNA按照Robert K FlamnC的方法提取,根据AtMGT3基因序列利用PrimerPremier 5.0软件设计一对引物,正向引物序列为5′-TYGGACTCCTYCTGTYI'CACTGG-3′,反向引物序列为5′-AAGCCTAAGCTCAGCA AAAGACA-3′,用高保真酶Pyrobest DNA Polymerase进行PCR扩增,回收目的片段,连接到pMDl8-T载体上,再用EcoR I和j(pn I酶切,定向克隆至表达载体pTrc99A,并酶切鉴定阳性克隆。

    1.4 生物信息学分析的主要软件及数据库

    基因序列数据由NCBI中获得,跨膜区分析软件为TMHMM,多序列比对软件为ClustalW,常规的核酸蛋白分析软件利用DNAMAN进行。

, 百拇医药     1.5 表达模式分析

    根据Ambiogen公司的RNA提取方法提取各个组织的总RNA:根、茎、叶、花、果;取相同量的不同组织的RNA,用eDNA合成试剂盒M-MLVReverse Transcriptase(Invitrogen公司)合成cDNA,应用软件Primer Premier 5.0设计特异的表达模式引物:正向引物序列为5′-CCTrGACCCTITGTI'TATCTATC-3′,反向引物序列为5′-CTCAGTCAAATACATCTCAGCC-3′,PCR扩增:以β-Actin作为内参,以不同组织的总eDNA作为模板进行PCR扩增,最后进行琼脂糖电泳检测。

    1.6 MM281功能互补实验

    挑取MM281,MM281-pTrc99A,MM281-PTrC99A-AtMGTl0,MM281,pTrc99A-AtMGT3的单菌落在试管中过夜培养,然后再按50:1(50mLLB:1 mL菌液)的比例接种于含有相应抗生素的锥形瓶中扩大培养。
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    测菌OD600,当达到0.6~0.7时加入1mmol/L的IPTG进行诱导,诱导至OD600达到1.0时取出转化的菌液100μL,以10的倍数稀释10-1、10-2、10-3、10-4、10-4mmol/L 5个浓度梯度,将稀释的菌液各取2μL点样于互补N-Minimal固体培养基上,37℃倒置培养2d,观察菌落生长情况。

    1.7 液体生长曲线

    挑取MM281,MM281-pTrc99A-AtMGTl0,MM281-pTrc99A-AtMGT3的单菌落在含相应抗生素的LB中摇菌,摇至OD600=0.6~0.8时,5000g离心收获细胞,用去离子水清洗两遍,以除去残留的Mg2+,然后悬浮在去离子水中,准备4种不同Mg2+浓度(100μmol/L,500μmol/L,2mmol/L,10mmol/L)和相应抗生素的N-minimal培养基,将上述准备好的培养物(起始OD600=0.001~0.002)加入N-Minimal培养基,37℃菌,24h测OD 600监测生长情况。
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    1.8 阳离子敏感性实验

    配制pH 7.0含0.1mol/L Mg2+的不同二价离子N-Minimal固体培养基,这些二价阳离子包含Cd2+、CO2+、Cu2+、Fe2+、Mn2+、Ni2+,每种离子分别配制了一系列的浓度梯度(0、10、100μmol/L,1、10mmol/L)。

    按功能互补实验过程一样准备好菌液,然后点至不同浓度的金属离子板上,37℃倒置培养1d后观察其生长情况并拍照。

    2 结果与分析

    2.1 AtMGT3的cDNA序列的结构分析

    用从拟南芥基因研究中心(ACI)得到的基因信息,设计特异性引物,通过RT-PCR来扩增AtMGT3基因的预测编码区,通过测序分析,所得到AtMGl3的开放阅读框含有1266 bp的核苷,编码421AA的蛋白,其序列与AGI中心预测的序列一致,与AtMGT1相比,AtMGT3的C端序列有两个跨膜区,第1个跨膜区是Leu337和Asn379之间,第2个跨膜区是Phe391和Phe413之间,AtMGT3拥有完整的转运镁离子的结构(图1 A,B)。
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    2.2 AtMGT3的表达模式

    以β-Actin作为内参,对AtMGl3进行表达模式分析,通过平台期摸索,确定了Actin基因在32个循环时达到平台期;而AtMGT3基因在35个循环时达到平台期,因此,在表达模式分析中,Actin引物进行29个循环的扩增,AtMGT3引物进行32个循环的扩增,由图2可以看出,AtMGl3在根、茎、叶、花、果中都有表达,其中,在花中的表达量最高,而在根中的表达量最低。

    2.3 AtMGT3可功能互补MM281的生长

    MM281是一类丧失了CorA,MgtA,MgtB Mg2+转运系统的沙门氏杆菌突变株,它只能在高浓度Mg2+(>100mmol/L)下达到最佳生长速度,结合功能互补的方法,它可作为一个研究Mg2+转运的很好的系统,表达了AtMGT3的MM281重组菌株可在低浓度Mg2+情况下生长,而其阴性对照MM281,, 百拇医药(邓沛怡 田连福 陈 键 栾 升 李东屏)
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