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编号:11608286
杜氏盐藻RUBisCO小亚基基因的克隆和分析
http://www.100md.com 2008年3月1日 柴玉荣等
杜氏盐藻RuBisCO小亚基基因的克隆和分析,盐藻细胞,-二磷酸核酮糖羧化酶,加氧酶,rbcS,RACE,氨基酸序列,简并引物,测序分析
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    柴玉荣 刘国红 刘红涛 李杰 薛乐勋 郑州大学细胞生物学研究室 郑州大学基础医学院组胚教研室 郑州大学细胞生物学研究室 郑州大学细胞生物学研究室 郑州大学细胞生物学研究室

    【摘要】根据莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)、团藻(Volvox carteri)、伞藻(Acetabularia cliftonii)等生物的1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶(RuBisCO)的小亚基rbcS基因氨基酸的高度保守序列,设计一对简并引物,进行RT-PCR.209bp的PCR产物经测序分析及进行氨基酸序列同源性比对,表明克隆的序列为盐藻rbcS基因的cDNA片段.根据该序列信息,采用RACE(rapid amplification of cDNA ends)的方法扩增其5′上游未知区和3′下游未知区.5′RACE得到的cDNA长度为约300bp,3′RACE得到的长度约380bp.三段序列拼接后cDNA全长为878bp,其中开放读码框包括190个氨基酸.此cDNA序列,推导成氨基酸序列与已知物种的rbcS基因相比对,同源性分别为V.carteri78%,C.reinhardtii75%,A.cliftonii67%,据此可推断所克隆的序列为盐藻RuBisCO的小亚基cDNA序列,GenBank收录号为AY739272.

    【关键词】 盐藻细胞 -二磷酸核酮糖羧化酶 加氧酶 rbcS RACE 氨基酸序列 基因 小亚基 简并引物 测序分析

    【基金】国家自然科学基金资助项目(30540067)

    【分类号】Q943.2

    1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶(Ribulose1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase,E.C.4.1.1.39简称RuBisCO)是光合作用中的关键酶,催化羧化反应和氧合反应,由8个大亚基(rbcL)和8个小亚基(rbcS)组成,其中大亚基由叶绿体基因编码,小亚基由核基因编码,大亚基起催化作用而小亚
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     摘要:根据莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)、团藻(Valvox carteri)、伞藻(Acetnbularia cliftonii)等生物的1.5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶(RuBisCO)的小亚基r6cS基因氨基酸的高度保守序列,设计一对简并引物,进行RT-PCR.209 bp的PCR产物经测序分析及进行氨基酸序列同源性比对,表明克隆的序列为盐藻rbcS基因的cDNA片段,根据该序列信息,采用RACE(rapid amplification of cDNA ends)的方法扩增其5’上游未知区和3’下游未知区,5’RACE得到的cDNA长度为约300 bp,3’RACE得到的长度约380 bp,三段序列拼接后cDNA全长为878 bp,其中开放读码框包括190个氨基酸,此cDNA序列,推导成氨基酸序列与已知物种的r6cS基因相比对,同源性分别为V.carteri 78%,C.reinhardtii 75%,A.cliftonii 67%,据此可推断所克隆的序列为盐藻RuBisCO的小亚基cDNA序列,GenBank收录号为AY739272。

    关键词:盐藻;1,5-二磷酸核酮糖羧化酶;加氧酶;r6cS;RACE

    中图分类号:Q754

    文献标识码:A

    文章编号:1007-7847(2008)01-0029-06Analysis and Cloning Of the Small Subunit Gene Of RuBisCO Of Dunaliella salina

    注:本文中所涉及到的图表、注解、公式等内容请以PDF格式阅读原文

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