运用染色质免疫沉淀技术筛选AP-2α的靶基因
AP-α,基因表达调控,转录因子,酶切,调控网络,质粒,蛋白质相互作用
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贺爱兰 肖湘文 孙一兵 刘如石 胡翔 周建林 张健 湖南师范大学生命科学学院蛋白质化学与发育生物学教育部重点实验室 湖南师范大学生命科学学院蛋白质化学与发育生物学教育部重点实验室 湖南师范大学生命科学学院蛋白质化学与发育生物学教育部重点实验室 湖南师范大学生命科学学院蛋白质化学与发育生物学教育部重点实验室 湖南师范大学生命科学学院蛋白质化学与发育生物学教育部重点实验室 湖南师范大学生命科学学院蛋白质化学与发育生物学教育部重点实验室 湖南师范大学生命科学学院蛋白质化学与发育生物学教育部重点实验室
【摘要】在后基因组时代,DNA-蛋白质的相互作用是研究基因表达调控的一个重要领域.染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation assay,简称ChIP)是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法.对与ChIP有关的实验条件进行了优化,获得了较优的实验条件,并运用ChIP实验筛选出了转录因子activatorprotein-2alpha(AP-2α)的未知靶基因,对于进一步研究AP-2α的功能和调控网络打下了基础.
【关键词】 染色质免疫沉淀技术 靶基因 AP-α 基因表达调控 转录因子 酶切 调控网络 质粒 蛋白质相互作用 筛选
【基金】国家重点基础研究专项经费资助项目(2006CB0F0306) 教育部科技创新工程重大项目培育资金项目(705041) 湖南省教育厅科学研究项目(05B391)
【分类号】Q78
真核生物基因组DNA以染色质的形式存在.因此,研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径.染色质免疫沉淀技术是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法[1].它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,并将其随机切断为一定长
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摘要：在后基因组时代。DNA。蛋白质的相互作用是研究基因表达调控的一个重要领域。染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation assay，简称ChIP)是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。对与ChIP有关的实验条件进行了优化。获得了较优的实验条件。并运用ChIP实验筛选出了转录因子activator protein-2 alpha(AP-2α)的未知靶基因，对于进一步研究AP-2α的功能和调控网络打下了基础。
关键词：染色质免疫沉淀技术；靶基因；AP-2α
中图分类号：Q786
文献标识码：A
文章编号：1007-7847(2008)02-0150-04
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