水稻长穗颈eui突变体长选3S最上节间基因差异表达研究
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2009年12月1日
基因芯片,差异表达基因,代谢相关基因,半定量,次生代谢物质,转录本
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邓力喜 于正芳 王锋 梁满中 陈良碧 湖南师范大学生命科学学院;
【摘要】利用水稻全基因组芯片和半定量PCR对水稻长穗颈eui突变体长选3S与对照培矮64S最上节间快速伸长期的基因差异表达分析,在检测到的56983芯片杂交点只发现527个差异表达转录本,其中上调表达的362个,下调表达的165个.生物信息分析发现,差异表达的转录本包括信号传导相关基因、膜及运输基因、细胞生长与凋亡相关基因、复制与修复相关基因、碳代谢相关基因,次生代谢物合成相关基因和其它功能未知基因.研究结果为了解水稻最上节间伸长机制提供了非常有用的信息.
【关键词】 水稻 长穗颈 基因芯片 差异表达基因 突变体 基因差异表达 代谢相关基因 半定量 次生代谢物质 转录本
【基金】湖南省自然科学基金(06JJ50033)
【分类号】S511
株高是水稻最重要性状之一,矮化育种和推广矮秆高产品种为标志的水稻绿色革命对世界的粮食生产做出了巨大的贡献.自20世纪50年代开展矮化育种以来,有关水稻株高的遗传研究、株高突变体的筛选与创制等方面的研究逐步深入,许多新的株高突变体不断被发现[1~4].Okuno K和Kawai T[1
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摘要：利用水稻全基因组芯片和半定量PCR对水稻长穗颈eui突变体长选3S与对照培矮64S最上节间快速伸长期的基因差异表达分析，在检测到的56983芯片杂交点只发现527个差异表达转录本，其中上调表达的362个，下调表达的165个，生物信息分析发现，差异表达的转录本包括信号传导相关基因、膜及运输基因、细胞生长与凋亡相关基因、复制与修复相关基因、碳代谢相关基因，次生代谢物合成相关基因和其它功能未知基因，研究结果为了解水稻最上节间伸长机制提供了非常有用的信息。
关键词：水稻；长穗颈；基因芯片；差异表达基因
中图分类号：Q945 文献标识码：A 文章编号：1007-7847(2009)04-0309-04
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