茶陵野生稻冷响应基因OrCr3的克隆及其生物信息学分析
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2013年3月1日
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参见附件。
刘伟 龚曼 陈淑媛 梁杰婧 徐孟亮 湖南师范大学生命科学学院;
【摘要】OrCr3(Oryza rufipogon cold responsive gene 3)是一个从茶陵野生稻中发现的受低温诱导表达的基因.以茶陵野生稻为材料克隆了其cDNA及其启动子区域序列,生物信息学分析表明,该基因的完整ORF(open reading frame)长为1 110 bp,推测编码一个由369个氨基酸残基组成的山梨糖醇脱氢酶蛋白,理论相对分子质量为39.3 kD,pI值为6.03;山梨糖醇脱氢酶具有催化山梨糖醇向果糖转变的作用;对OrCr3的启动子区域进行分析,发现多种可能与逆境应答相关的顺式作用调控元件;该基因编码的蛋白在不同物种中存在高度相似性.以上结果说明OrCr3基因可能是一个保守的耐逆相关基因.
【关键词】 普通野生稻 基因克隆 逆境 生物信息学分析
【基金】湖南省科技计划重点项目(2012FJ2013) 湖南省教育厅重点科研项目(10A072) 湖南省自然科学基金资助项目(10JJ3028) 湖南省生态学重点学科建设项目(0713)
【分类号】S511.9
植物在遇到不利于生物生长、繁殖的各种非生物环境时,会造成植物体在生理生化水平、细胞组织水平甚至个体水平上的一连串连锁反应以应对逆境对植物生存、生长与发育可能造成的有害作用.实验结果显示:在不利于生物生长、繁殖的环境下,植物体内不同种类的编码基因被激活或抑制.
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