2.3 3 条染色体基因的最优密码子

    根据RFSC的计算结果，利用高频密码子分析法分析其最优越密码子。其中编码Arg的AGC和AGA、Val的GTG、Leu的CTG，以及终止密码子rllAC的Result值都超过了1.5，可以将其定义为最优密码子。

    2.4 密码子使用的异质性

    不同物种中，除了极端偏嗜的物种外.多数物种基冈组内不同基因的密码子使用具有较强的异质性。本研究采用FNC值和GC3值来评估人类1号、X、Y染色体上基因组密码子使用的异质性.发现其ENC值在21～61之间变化，平均值为48.91，标准差为6.507，其中ENC值在20～30范围内的仅有23个，在30～40范围的并不多，绝大部分集中在40～61的范围内，其中等于61的有44个，说明这3条染色体上基因之问的密码子使用具有较大的差异。如图2所示，这3条染色体基冈的GC，值的统计结果也证明了这一结果。其中GC3s值在0.166～0.968之间，平均值0.573，标准差0.157。以上结果显示，除了碱基组成的限制，人类1号、X、Y染色体基因的密码子使用还受到其他因素的影响。

    2.5 ENC-plot分析

    利用有效密码子数与GC3s含量绘制散点图能直观地反映出密码子使用偏好性的情况(图3) ......