人类1号、X、Y染色体基因密码子偏好性研究(1)
摘要:随着人类基因组计划测序工作的完成,进一步数据挖掘工作已成为新的研究热点 根据人类1号、X、Y染色体数据,通过自编的Perl程序,提取3条染色体基因的CDS序列,利用密码子偏好性的理论及生物信息学方法分析其碱基组成特点和密码子使用模式,确定了偏好密码子和最优密码子,探讨影响其密码子用法的主要因素结果表明:1)人类1号、X、Y染色体基因偏好使用以C或C结尾的密码子:2)密码子的使用受基因长度的影响,较长的基因具有较高的表达水平和密码子使用偏性;3)基因表达水平对人类l号、X、Y染色体基因的密码子使用没有影响.暗示了这3条染色体并未承受翻译选择的压力;4)人类1号.X.Y染色体基因共有32个偏好性密码子,其中编码Arg的Arg和AGG、编码Val的GTG、编码Leu的CTG、终止密码子TAG为最优密码子关键词:人类染色体:基因:密码子偏好性
中图分类号:Q348
文献标识码:A
文章编号:1007-7847( 2014)05-0387-08
随着人类基因组计划测序工作的完成,进一步数据挖掘工作已成为新的研究热点。在人类全部22对常染色体中l号染色体是最大的染色体,包含基因数量最多 ......
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