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编号:12728467
斑马鱼TATA结合蛋白的生物信息学分析(1)
http://www.100md.com 2015年2月1日 《生命科学研究》 2015年第2期
斑马鱼TATA结合蛋白的生物信息学分析,生物信息学中图分类号,Q811.4
     摘要:斑马鱼TATA结合蛋白(TBP)是转录过程中的重要起始因子。利用生物信息学方法对斑马鱼TBP的理化性质、物种间同源性、保守结构域、跨膜区、亲水性/疏水性,蛋白质二级结构、蛋白质三级结构、蛋白质相互作用进行预测分析 分析表明,斑马鱼TBP全长302个氨基酸,等电点9.8,属于TATA结合蛋白超家族,不含跨膜区.属于亲水蛋白;二级结构以无规则卷曲为主,含5个α螺旋区和8个β折叠区,三维建模空间结构可信度98.9%,进一步分析建模结果可靠:与斑马鱼TBP相互作用的蛋白质均为转录因子或TFⅡD复合物组分。分析结果对于深入研究斑马鱼TBP在基因转录中的作用具有一定的理论指导意义。关键词:斑马鱼;TATA结合蛋白;生物信息学中图分类号:Q811.4

    文献标识码:A

    文章编号:1007-7847(2015)02-0119-05Bioinformatic Analysis of TATA-binding Protein of ZebrafishYANG Shao-bin, FENG Jing-wen, ZHAO Wen-cheng ......
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