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编号:12871087
马蓝与路边青的matK序列差异与分子鉴定方法分析(1)
http://www.100md.com 2016年6月1日 《中国民族民间医药·下半月》2016年第6期
     【摘 要】 目的:研究拟基于matK序列分析,探讨马蓝与路边青相互鉴别的新方法。方法:从GenBank核酸数据库下载马蓝与路边青matK 序列,应用ClustalX 2.1软件进行SNP鉴别位点分析,应用 MEGA5.0 软件计算种内和种间的(K2P)遗传距离,并构建邻接(NJ)系统聚类树。结果:获得8个马蓝matK序列及12个路边青matK序列,分析显示马蓝与路边青的matK序列具有近百个SNP位点,且其中多是马蓝与路边青特有的,可作为二者间相互鉴别的分子标记。且马蓝的最大种内 K2P 遗传距离0.001 与路边青最大种内 K2P 遗传距离0.005均远远小于马蓝与路边青的种间 K2P 遗传距离0.144~0.149,构建的系统发育树显示马蓝与路边青单独聚为一类。结论:matK序列可为马蓝与路边青的相互鉴别提供新的分子鉴定方法 ......
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