基于网络药理学及分子对接筛选大血藤防治类风湿性关节炎的关键靶点及活性成分(2)
1.2 通路分析 基于DAVID(https://david. ncifcrf.gov/)和KOBAX3.0(KEGG Orthology Based Annotation System)对RA靶标基因进行通路富集分析,DAVID是基于WEB服务器的富集分析软件。对RA靶点进行GO功能、通路和疾病分析等;KOBAS软件的功能模块中有ID Mapping,将RA基因通过数据库富集到相应的通路中。分析结果得到RA靶点参与的通路途径,选择RA靶点显著参与的途径(P≤0.01),基于Rstudio软件中的ggplot 2绘制气泡图,包括通路名称、富集分析的P值、Rich factor和Q值等。1.3 相互作用分析 采用STRING结合Cytoscape 3.5.1对RA通路中16个RA靶点进行相互作用分析,STRING是蛋白质相互作用数据库,可进行是搜索已知蛋白之间和预测蛋白质之间相互作用,通过蛋白质名称进行检索16个蛋白质相互作用的相关性。
1.4 大血藤活性成分筛选 大血藤小分子化合物基于中药系统药理学数据库和分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology ......
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