基于网络药理学研究益智仁治疗阿尔兹海默症的物质基础与作用机制(3)
2.2 AD相关基因与益智仁-AD共同作用靶点的获取 在GeneCards和OMIM数据库中输入关键词“Alzheimer’s Disease”后分别收集到8718、384个AD相关基因。将上述基因去重、规范后得到8435个AD相关基因。将这8435个AD相关基因与“2.1”项下得到的156个益智仁潜在活性成分所对应的靶点进行映射,得到113个“益智仁-AD”的共同靶点,并通过R语言绘制venn图,结果见图1。2.3 “益智仁-潜在活性成分-相关靶点-AD”网络图构建与分析 去除无对应靶点的β-谷甾醇棕榈酸酯以及重复靶点,将剩下的9个益智仁潜在活性成分与113个“益智仁-AD”共同靶点导入Cytoscape3.6.1软件,绘制“益智仁-潜在活性成分-相关靶点-AD”相互作用网络图。由拓扑分析得,益智仁中潜在活性成分与各个靶点的边的数量较多的是白杨素、原儿茶酸、圆柚酮和豆甾醇,分别有85、17、11和10条边,这四种成分可能是益智仁治疗AD的重要活性成分,结果见图2。
2.4 PPI网络图的构建 由网络拓扑分析及统计分析每个节点得知113个靶点间共有667条连接关系 ......
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