人类表皮生长因子受体 2的 B细胞表位初步预测分析
跨膜,亲水性,1材料与方法,2结果,3讨论
周珠哈,王 安,吴 乐,朱珊丽,朱冠保,张丽芳人类表皮生长因子受体2(HER2/neu)是一种原癌基因,定位于染色体 17q21,编码一个 185 kDa的跨膜受体酪氨酸激酶,也称为 p185[1],是表皮生长因子受体 (EGFR)家族的第二成员,HER2/neu自身可形成同源二聚体或与 EGFR其他成员形成异源二聚体,继而发生磷酸化,激活其胞内酪氨酸激酶,将细胞生长信号和其他相关信号持续地传导给细胞,最终导致细胞的增殖、癌变、对化疗药物耐受等一系列生物学性状的改变[2]。HER2/neu基因的扩增或过度表达见于许多上皮源性肿瘤中,如原发性浸润性乳腺癌 (25% ~30%)、胃癌(10%~20%),其表达程度与肿瘤的临床分期及预后密切相关[3-4],是不良预后的独立预测因子[5-6]。曲佐单抗 (herceptin)是人源化的 HER2/neu靶向单克隆抗体,在 HER2/neu过表达的乳腺癌及胃癌患者的临床治疗中取得了显著疗效[7-8]。使 HER2/neu成为理想的抗肿瘤免疫治疗的靶标。B细胞表位是抗原中可被 B细胞抗原受体或抗体特异性识别并结合的线性片段或空间构象结构。对 B细胞表位进行准确预测,不仅有助于肿瘤基础免疫学研究,而且对肿瘤疫苗和抗体的研究与开发、诊断与治疗均具有重要意义。本研究利用生物信息软件系统及相关抗原性指数等,预测分析了 HER2/neu的二级结构及其 B细胞优势表位,为 HER2/neu单克隆抗体的制备和基因工程疫苗的设计和研究提供理论依据。
1 材料与方法
1.1 材料 HER2/neu氨基酸序列:HER2/neu完整蛋白质的氨基酸序列检索自 Swiss Prot蛋白质数据库。
1.2 方法 HER2/neu二级结构预测:采用 EXPASY服务器提供的 SOPMA、GOR、HNN方法预测。HER2/neu跨膜区域预测:采用 EXPASY服务器提供的 SOSUI方法。HER2/neu亲水性、表面可及性、抗原性、极性及柔韧性参数预测:采用EXPASY服务器提供的 Hopp& Woods、Zimmerman方法和DNAstar软件的 Protean进行 Emini和 Jameson-Wolf分析 ......
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