应用基因芯片技术筛选肝细胞癌相关基因
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梅铭惠 陈谦 廖维甲 覃理灵 桂林医学院附属医院肝胆外科;
【摘要】目的:应用基因芯片技术筛选肝细胞癌相关基因。方法:利用CapitalBio公司基因芯片,对肝细胞癌组织和正常组织基因表达谱进行检测,并利用生物信息学方法对检测结果进行分析。结果:按差异显著性标准,从16000条基因中筛选出在肝细胞癌组织中共同差异表达基因326个,其中已知基因194个,新基因132个。在筛选出的已知基因中,表达上调113个,表达下调81个,包括原癌基因和抑癌基因、免疫相关基因、细胞信号和传递蛋白相关基因、蛋白翻译和合成相关基因、代谢相关基因、细胞周期蛋白相关基因、细胞骨架相关基因、细胞凋亡相关基因、DNA合成和修复相关基因等。结论:基因表达谱芯片技术可以筛选出肝细胞癌表达异常的相关基因群,并高效对基因功能进行研究。基因表达谱的分析有助于研究肝细胞癌发病机制。
【关键词】 肝细胞癌 基因芯片 基因表达谱
【基金】广西科学研究与技术开发计划项目(桂科攻0428005-7) 广西卫生厅重点科研课题资助(合同编号:重200653)
【分类号】R735.7
肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的发生、发展是一个复杂的多阶段、多因素、多基因参与的过程。本研究采用基因芯片技术检测HCC组织与正常肝组织之间的基因表达差异,并利用生物信息学方法对筛选的已知相关基因进行初步分析,探讨HCC发病机制。1材料与实验方法1.1材料
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摘要：目的：应用基因芯片技术筛选肝细胞癌相关基因。方法：利用CapitalBio公司基因芯片，对肝细胞癌组织和正常组织基因表达谱进行检测，并利用生物信息学方法对检测结果进行分析。结果：按差异显著性标准，从16000条基因中筛选出在肝细胞癌组织中共同差异表达基因326个，其中已知基因194个，新基因132个。在筛选出的已知基因中，表达上调113个，表达下调81个，包括原癌基因和抑癌基因、免疫相关基因、细胞信号和传递蛋白相关基因、蛋白翻译和合成相关基因、代谢相关基因、细胞周期蛋白相关基因、细胞骨架相关基因、细胞凋亡相关基因、DNA合成和修复相关基因等。结论：基因表达谱芯片技术可以筛选出肝细胞癌表达异常的相关基因群，并高效对基因功能进行研究。基因表达谱的分析有助于研究肝细胞癌发病机制。
关键词：肝细胞癌；基因芯片；基因表达谱
中图分类号：R735.7 文献标识码：A 文章编号：1008—2409(2008)06—1043—03
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