人ＡＬＫ－1近端启动子的生物信息学分析
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舒茂国 郭树忠 郭晓彤 王昕红 李立文 第四军医大学西京医院整形科 第四军医大学西京医院整形科 第四军医大学西京医院肿瘤中心 陕西航天医院 第四军医大学西京医院全军骨科研究所
【摘要】目的:对人ALK-1启动子进行生物信息学分析。方法:从Genebank获取人类基因组序列和人ALK-1 mRNA序列,使用FirstEF程序分析并获得ALK-1近端启动子序列,并使用MatInspector程序对启动子序列中的转录因子结合位点进行预测。结果:使用FirstEF程序成功获得了长度为1Kb的人ALK-1近端启动子序列。MatInspector程序分析该启动子中共含有136个顺式转录调控元件,包括多种早期生长反应基因家族成员、Myc相关锌指蛋白家族成员和Ets家族成员等。值得注意的是在ALK-1启动子中含有6个KLF6结合元件,提示ALK-1参与创面愈合和组织重建过程。结论:获得了人
【关键词】 ALK- 启动子 生物信息学
【基金】陕西省攻关计划(批准号:2004K16-G1(5))
【分类号】R622
启动子的生物信息学分析是研究特定基因表达调控机制的重要手段,可以通过对启动子序列中存在的顺式转录调节元件初步判定影响该基因转录的各种因素。ALK-1是由503个氨基酸残基构成的I型跨膜糖蛋白,分子量约为62kDa,包括21个氨基酸残基的信号肽,97个氨基酸残基的胞外区,23个氨
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[摘要]目的：对人ALK-1启动子进行生物信息学分析。方法：从Genebank获取人类基因组序列和人ALK-1 mRNA序列，使用Pi，stEF程序分析并获得ALK-1近端启动子序列，并使用Matlnspector程序对启动子序列中的转录因子结合位点进行预测。结果：使用PirstEF程序成功获得了长度为1Kb的人ALK-1近端启动子序列。Hatlnspector程序分析该启动子中共含有136个顺式转录调控元件，包括多种早期生长反应基因家族成员、Myc相关锌指蛋白家族成员和Ets家族成员等。值得注意的是在ALK-1启动子中含有6个KLF6结合元件，提示ALK-1参与创面愈合和组织重建过程。结论：获得了人ALK-1近端启动子的转录调控信息，推测KLF6可强烈诱导ALK-1基因表达。
[关键词]ALK-1，启动子，生物信息学
[中图分类号]R619.6 [文献标识码]A [文章编号]1008—6455(2005)02—0149—03
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