沈剑 廖海英 黄谦

    [摘要]目的：基于生物信息學构建GOPC(golgi associated PDZ and coiled-coil motif containing)的皮肤黑素瘤(Skin cutaneous melanoma，SKCM)预后模型，进一步为SKCM的早期筛查发挥一定的指导意义。方法：提取癌症基因组图谱TCGA数据库中的SKCM数据和GTEx数据库对应的正常组织数据。利用ggplot2包绘制GOPC在两者之间的表达差异。采用基因本体(GO)数据库和京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库对GOPC基因进行进一步功能富集分析，探索该基因潜在的功能和通路。采用单因素/多因素Cox回归分析筛选与SKCM相关的影响因素，再通过rms包构建列线图建立SKCM患者预后模型，ROC曲线评价构建的模型预测SKCM患者预后的价值，最后通过survival包构建关于总生存期(Overall survival，OS)的生存曲线。结果：在1282例样本中正常组织样本有813例、皮肤黑素瘤组织样本有469例，发现GOPC在这两组之间有表达差异(P<0.001)。该模型预测SKCM患者总生存的ROC曲线下面积(AUC)为0.776，说明其具有一定的诊断价值。K-M曲线中GOPC高表达预后较差(P=0.036)。在多因素COX回归中GOPC在SKCM中也是独立预后风险因素(HR=0.506，95%CI=0.263～0.971，P=0.041)，表明模型对SKCM患者生存具有较高的预测能力。结论：构建的SKCM的GOPC基因预后模型可用于预测SKCM患者的预后，为黑素瘤的精准化治疗提供了新的思路。

    [关键词]生物信息学；黑素瘤；预后模型；GOPC；生物标志物

    [中图分类号]R739.5? ? [文献标志码]A? ? [文章编号]1008-6455(2023)03-0070-05 ......